Silicon in PDB 7zcj: Crystal Structure of PIZZA6-Tnh-Tsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate

The structure of Crystal Structure of PIZZA6-Tnh-Tsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate, PDB code: 7zcj was solved by S.M.L.Wouters, K.Kamata, K.Takahashi, L.Vandebroek, T.N.Parac-Vogt, J.R.H.Tame, A.R.D.Voet, with X-Ray Crystallography technique. A brief refinement statistics is given in the table below:

Resolution Low / High (Å)	47.73 / 1.56
Space group	P 41 21 2
Cell size a, b, c (Å), α, β, γ (°)	69.181, 69.181, 131.877, 90, 90, 90
R / Rfree (%)	16.2 / 18.3

The structure of Crystal Structure of PIZZA6-Tnh-Tsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate also contains other interesting chemical elements:

Tungsten

(W)

24 atoms

The binding sites of Silicon atom in the Crystal Structure of PIZZA6-Tnh-Tsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate (pdb code 7zcj). This binding sites where shown within 5.0 Angstroms radius around Silicon atom.
In total 2 binding sites of Silicon where determined in the Crystal Structure of PIZZA6-Tnh-Tsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate, PDB code: 7zcj:
Jump to Silicon binding site number: 1; 2;

Silicon binding site 1 out of 2 in the Crystal Structure of PIZZA6-Tnh-Tsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Silicon with other atoms in the Si binding site number 1 of Crystal Structure of PIZZA6-Tnh-Tsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate within 5.0Å range: probe atom residue distance (Å) B Occ A:Si301 b:18.8 occ:0.27 SI1 A:SIW301 0.0 18.8 0.3 SI1 A:SIW301 0.1 18.8 0.2 O19E A:SIW301 1.5 18.8 0.2 O19E A:SIW301 1.5 18.8 0.3 O4 A:SIW301 1.5 18.8 0.3 O4 A:SIW301 1.6 18.8 0.2 O22 A:SIW301 1.6 18.8 0.2 O22 A:SIW301 1.6 18.8 0.3 O21 A:SIW301 1.7 18.8 0.2 O21 A:SIW301 1.7 18.8 0.3 O18 A:SIW301 3.2 18.8 0.2 O2E A:SIW301 3.3 18.8 0.3 O17 A:SIW301 3.3 18.8 0.2 O8E A:SIW301 3.3 18.8 0.3 O18 A:SIW301 3.4 18.8 0.3 O17 A:SIW301 3.4 18.8 0.3 O8E A:SIW301 3.4 18.8 0.2 W6 A:SIW301 3.4 18.8 0.2 O23 A:SIW301 3.4 18.8 0.2 W3 A:SIW301 3.5 18.8 0.2 W6 A:SIW301 3.5 18.8 0.3 W5 A:SIW301 3.5 18.8 0.3 W5 A:SIW301 3.5 18.8 0.2 O23 A:SIW301 3.5 18.8 0.3 W3 A:SIW301 3.5 18.8 0.3 O16 A:SIW301 3.5 18.8 0.2 O2E A:SIW301 3.5 18.8 0.2 O15 A:SIW301 3.5 18.8 0.2 W5E A:SIW301 3.5 18.8 0.3 W5E A:SIW301 3.5 18.8 0.2 W1E A:SIW301 3.5 18.8 0.2 W3E A:SIW301 3.5 18.8 0.2 W2 A:SIW301 3.5 18.8 0.2 W1E A:SIW301 3.6 18.8 0.3 O15 A:SIW301 3.6 18.8 0.3 W2 A:SIW301 3.6 18.8 0.3 W1 A:SIW301 3.6 18.8 0.3 W4 A:SIW301 3.6 18.8 0.2 W3E A:SIW301 3.6 18.8 0.3 O1E A:SIW301 3.6 18.8 0.2 W1 A:SIW301 3.6 18.8 0.2 O9E A:SIW301 3.6 18.8 0.3 W4 A:SIW301 3.6 18.8 0.3 O16 A:SIW301 3.6 18.8 0.3 O9E A:SIW301 3.6 18.8 0.2 O18E A:SIW301 3.6 18.8 0.2 W2E A:SIW301 3.6 18.8 0.2 O20 A:SIW301 3.6 18.8 0.2 W2E A:SIW301 3.6 18.8 0.3 O1E A:SIW301 3.6 18.8 0.3 W4E A:SIW301 3.6 18.8 0.3 O20 A:SIW301 3.6 18.8 0.3 W7 A:SIW301 3.7 18.8 0.2 W4E A:SIW301 3.7 18.8 0.2 W7 A:SIW301 3.7 18.8 0.3 O18E A:SIW301 3.7 18.8 0.3 O7 A:SIW301 3.7 18.8 0.2 O7 A:SIW301 3.7 18.8 0.3 O8 A:SIW301 3.7 18.8 0.2 O2 A:SIW301 3.7 18.8 0.2 O8 A:SIW301 3.7 18.8 0.3 O17E A:SIW301 3.8 18.8 0.3 O9 A:SIW301 3.8 18.8 0.3 O23E A:SIW301 3.8 18.8 0.2 O17E A:SIW301 3.8 18.8 0.2 O2 A:SIW301 3.8 18.8 0.3 O16E A:SIW301 3.8 18.8 0.2 O9 A:SIW301 3.8 18.8 0.2 O1 A:SIW301 3.9 18.8 0.3 O23E A:SIW301 3.9 18.8 0.3 O3 A:SIW301 3.9 18.8 0.3 O15E A:SIW301 3.9 18.8 0.2 O20E A:SIW301 3.9 18.8 0.3 O1 A:SIW301 3.9 18.8 0.2 O20E A:SIW301 3.9 18.8 0.2 O15E A:SIW301 3.9 18.8 0.3 O3 A:SIW301 4.0 18.8 0.2 O16E A:SIW301 4.0 18.8 0.3 O7E A:SIW301 4.0 18.8 0.2 O3E A:SIW301 4.1 18.8 0.2 O7E A:SIW301 4.1 18.8 0.3 O3E A:SIW301 4.3 18.8 0.3

Silicon binding site 2 out of 2 in the Crystal Structure of PIZZA6-Tnh-Tsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Silicon with other atoms in the Si binding site number 2 of Crystal Structure of PIZZA6-Tnh-Tsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate within 5.0Å range: probe atom residue distance (Å) B Occ A:Si301 b:18.8 occ:0.23 SI1 A:SIW301 0.0 18.8 0.2 SI1 A:SIW301 0.1 18.8 0.3 O4 A:SIW301 1.5 18.8 0.3 O4 A:SIW301 1.5 18.8 0.2 O19E A:SIW301 1.5 18.8 0.2 O19E A:SIW301 1.6 18.8 0.3 O22 A:SIW301 1.6 18.8 0.2 O22 A:SIW301 1.6 18.8 0.3 O21 A:SIW301 1.7 18.8 0.3 O21 A:SIW301 1.7 18.8 0.2 O18 A:SIW301 3.2 18.8 0.2 O2E A:SIW301 3.2 18.8 0.3 O17 A:SIW301 3.3 18.8 0.2 O17 A:SIW301 3.3 18.8 0.3 O18 A:SIW301 3.3 18.8 0.3 W6 A:SIW301 3.4 18.8 0.2 O8E A:SIW301 3.4 18.8 0.3 W3 A:SIW301 3.4 18.8 0.3 O23 A:SIW301 3.4 18.8 0.2 W3 A:SIW301 3.4 18.8 0.2 O8E A:SIW301 3.4 18.8 0.2 W6 A:SIW301 3.4 18.8 0.3 O2E A:SIW301 3.5 18.8 0.2 W5 A:SIW301 3.5 18.8 0.3 O23 A:SIW301 3.5 18.8 0.3 W5E A:SIW301 3.5 18.8 0.2 W5 A:SIW301 3.5 18.8 0.2 W1 A:SIW301 3.5 18.8 0.3 W5E A:SIW301 3.5 18.8 0.3 O15 A:SIW301 3.5 18.8 0.2 W3E A:SIW301 3.5 18.8 0.2 W2 A:SIW301 3.5 18.8 0.3 O15 A:SIW301 3.5 18.8 0.3 W1 A:SIW301 3.5 18.8 0.2 O16 A:SIW301 3.6 18.8 0.2 O1E A:SIW301 3.6 18.8 0.2 W1E A:SIW301 3.6 18.8 0.2 W2 A:SIW301 3.6 18.8 0.2 O20 A:SIW301 3.6 18.8 0.2 O20 A:SIW301 3.6 18.8 0.3 W3E A:SIW301 3.6 18.8 0.3 W4 A:SIW301 3.6 18.8 0.3 W1E A:SIW301 3.6 18.8 0.3 O9E A:SIW301 3.6 18.8 0.2 O16 A:SIW301 3.6 18.8 0.3 O9E A:SIW301 3.6 18.8 0.3 W4 A:SIW301 3.6 18.8 0.2 W4E A:SIW301 3.6 18.8 0.3 W4E A:SIW301 3.7 18.8 0.2 W2E A:SIW301 3.7 18.8 0.2 O7 A:SIW301 3.7 18.8 0.3 O18E A:SIW301 3.7 18.8 0.2 O1E A:SIW301 3.7 18.8 0.3 W2E A:SIW301 3.7 18.8 0.3 W7 A:SIW301 3.7 18.8 0.3 O8 A:SIW301 3.7 18.8 0.3 W7 A:SIW301 3.7 18.8 0.2 O7 A:SIW301 3.7 18.8 0.2 O18E A:SIW301 3.7 18.8 0.3 O8 A:SIW301 3.7 18.8 0.2 O9 A:SIW301 3.7 18.8 0.3 O23E A:SIW301 3.7 18.8 0.2 O17E A:SIW301 3.8 18.8 0.2 O2 A:SIW301 3.8 18.8 0.2 O9 A:SIW301 3.8 18.8 0.2 O17E A:SIW301 3.8 18.8 0.3 O1 A:SIW301 3.8 18.8 0.3 O2 A:SIW301 3.8 18.8 0.3 O23E A:SIW301 3.8 18.8 0.3 O16E A:SIW301 3.8 18.8 0.2 O15E A:SIW301 3.8 18.8 0.2 O3 A:SIW301 3.9 18.8 0.3 O1 A:SIW301 3.9 18.8 0.2 O20E A:SIW301 3.9 18.8 0.3 O15E A:SIW301 3.9 18.8 0.3 O20E A:SIW301 3.9 18.8 0.2 O3 A:SIW301 4.0 18.8 0.2 O16E A:SIW301 4.0 18.8 0.3 O7E A:SIW301 4.1 18.8 0.2 O3E A:SIW301 4.1 18.8 0.2 O7E A:SIW301 4.2 18.8 0.3 O3E A:SIW301 4.3 18.8 0.3 O5 A:SIW301 5.0 18.8 0.2

S.Wouters, K.Kamata, K.Takahashi, L.Vandebroek, T.N.Parac-Vogt, J.R.H.Tame, A.R.D.Voet. Mutational Study of A Symmetry Matched Protein-Polyoxometalate Interface To Be Published.