Silicon in PDB 6qsg: Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta)
Protein crystallography data
The structure of Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta), PDB code: 6qsg
was solved by
H.Noguchi,
L.Vandebroek,
K.Kamata,
J.R.H.Tame,
L.Van Meervelt,
T.N.Parac-Vogt,
A.R.D.Voet,
with X-Ray Crystallography technique. A brief refinement statistics is given in the table below:
Resolution Low / High (Å)
|
29.97 /
1.15
|
Space group
|
C 1 2 1
|
Cell size a, b, c (Å), α, β, γ (°)
|
77.367,
44.668,
65.254,
90.00,
113.28,
90.00
|
R / Rfree (%)
|
16.8 /
18.6
|
Other elements in 6qsg:
The structure of Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta) also contains other interesting chemical elements:
Silicon Binding Sites:
The binding sites of Silicon atom in the Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta)
(pdb code 6qsg). This binding sites where shown within
5.0 Angstroms radius around Silicon atom.
In total 6 binding sites of Silicon where determined in the
Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta), PDB code: 6qsg:
Jump to Silicon binding site number:
1;
2;
3;
4;
5;
6;
Silicon binding site 1 out
of 6 in 6qsg
Go back to
Silicon Binding Sites List in 6qsg
Silicon binding site 1 out
of 6 in the Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta)
Mono view
Stereo pair view
|
A full contact list of Silicon with other atoms in the Si binding
site number 1 of Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta) within 5.0Å range:
probe
|
atom
|
residue
|
distance (Å)
|
B
|
Occ
|
A:Si301
b:6.4
occ:0.25
|
SI1
|
A:SIW301
|
0.0
|
6.4
|
0.2
|
SI1
|
A:SIW301
|
0.0
|
14.1
|
0.2
|
O19E
|
A:SIW301
|
1.5
|
27.6
|
0.2
|
O19E
|
A:SIW301
|
1.5
|
27.9
|
0.2
|
O4
|
A:SIW301
|
1.5
|
21.2
|
0.2
|
O4
|
A:SIW301
|
1.5
|
27.1
|
0.2
|
O21
|
A:SIW301
|
1.7
|
23.2
|
0.2
|
O21
|
A:SIW301
|
1.7
|
25.6
|
0.2
|
O22
|
A:SIW301
|
1.7
|
11.1
|
0.2
|
O22
|
A:SIW301
|
1.7
|
14.2
|
0.2
|
W3E
|
A:SIW301
|
3.5
|
17.9
|
0.2
|
O18
|
A:SIW301
|
3.5
|
29.7
|
0.2
|
W5E
|
A:SIW301
|
3.5
|
17.7
|
0.2
|
W4
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.3
|
0.2
|
W2
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.5
|
0.2
|
W2E
|
A:SIW301
|
3.5
|
11.3
|
0.2
|
W2
|
A:SIW301
|
3.5
|
17.7
|
0.2
|
W3E
|
A:SIW301
|
3.5
|
16.1
|
0.2
|
W7
|
A:SIW301
|
3.5
|
10.4
|
0.2
|
O18
|
A:SIW301
|
3.5
|
26.0
|
0.2
|
W4E
|
A:SIW301
|
3.5
|
11.1
|
0.2
|
W4E
|
A:SIW301
|
3.5
|
10.7
|
0.2
|
W7
|
A:SIW301
|
3.5
|
11.5
|
0.2
|
W5
|
A:SIW301
|
3.5
|
11.4
|
0.2
|
W2E
|
A:SIW301
|
3.5
|
10.4
|
0.2
|
W6
|
A:SIW301
|
3.5
|
12.3
|
0.2
|
W5
|
A:SIW301
|
3.5
|
11.6
|
0.2
|
W6
|
A:SIW301
|
3.5
|
11.7
|
0.2
|
W3
|
A:SIW301
|
3.5
|
11.6
|
0.2
|
W3
|
A:SIW301
|
3.5
|
11.5
|
0.2
|
W5E
|
A:SIW301
|
3.5
|
7.4
|
0.2
|
W1
|
A:SIW301
|
3.5
|
7.0
|
0.2
|
W4
|
A:SIW301
|
3.5
|
6.7
|
0.2
|
W1E
|
A:SIW301
|
3.6
|
6.7
|
0.2
|
W1E
|
A:SIW301
|
3.6
|
6.9
|
0.2
|
W1
|
A:SIW301
|
3.6
|
6.8
|
0.2
|
O18E
|
A:SIW301
|
3.6
|
13.4
|
0.2
|
O18E
|
A:SIW301
|
3.6
|
15.6
|
0.2
|
O9E
|
A:SIW301
|
3.6
|
16.1
|
0.2
|
O9E
|
A:SIW301
|
3.6
|
16.8
|
0.2
|
O2E
|
A:SIW301
|
3.6
|
15.1
|
0.2
|
O17
|
A:SIW301
|
3.6
|
5.2
|
0.2
|
O16
|
A:SIW301
|
3.6
|
23.3
|
0.2
|
O9
|
A:SIW301
|
3.6
|
23.8
|
0.2
|
O17
|
A:SIW301
|
3.6
|
6.6
|
0.2
|
O9
|
A:SIW301
|
3.6
|
17.9
|
0.2
|
O16E
|
A:SIW301
|
3.6
|
7.4
|
0.2
|
O23
|
A:SIW301
|
3.6
|
4.6
|
0.2
|
O16
|
A:SIW301
|
3.6
|
25.8
|
0.2
|
O16E
|
A:SIW301
|
3.6
|
4.7
|
0.2
|
O2
|
A:SIW301
|
3.6
|
16.5
|
0.2
|
O17E
|
A:SIW301
|
3.7
|
21.1
|
0.2
|
O8
|
A:SIW301
|
3.7
|
11.3
|
0.2
|
O23
|
A:SIW301
|
3.7
|
5.5
|
0.2
|
O8E
|
A:SIW301
|
3.7
|
16.8
|
0.2
|
O2
|
A:SIW301
|
3.7
|
15.3
|
0.2
|
O2E
|
A:SIW301
|
3.7
|
10.5
|
0.2
|
O17E
|
A:SIW301
|
3.7
|
24.8
|
0.2
|
O8
|
A:SIW301
|
3.7
|
12.2
|
0.2
|
O8E
|
A:SIW301
|
3.7
|
13.6
|
0.2
|
O1E
|
A:SIW301
|
3.7
|
22.5
|
0.2
|
O20
|
A:SIW301
|
3.7
|
15.7
|
0.2
|
O20E
|
A:SIW301
|
3.7
|
16.2
|
0.2
|
O20
|
A:SIW301
|
3.7
|
13.7
|
0.2
|
O20E
|
A:SIW301
|
3.7
|
10.1
|
0.2
|
O23E
|
A:SIW301
|
3.7
|
17.1
|
0.2
|
O1
|
A:SIW301
|
3.7
|
19.5
|
0.2
|
O1E
|
A:SIW301
|
3.7
|
21.0
|
0.2
|
O1
|
A:SIW301
|
3.7
|
14.7
|
0.2
|
O23E
|
A:SIW301
|
3.8
|
15.8
|
0.2
|
O7E
|
A:SIW301
|
3.8
|
4.2
|
0.2
|
O7E
|
A:SIW301
|
3.8
|
6.5
|
0.2
|
O15
|
A:SIW301
|
3.8
|
21.4
|
0.2
|
O7
|
A:SIW301
|
3.8
|
11.2
|
0.2
|
O7
|
A:SIW301
|
3.8
|
16.5
|
0.2
|
O15
|
A:SIW301
|
3.9
|
16.3
|
0.2
|
O15E
|
A:SIW301
|
3.9
|
15.1
|
0.2
|
O15E
|
A:SIW301
|
3.9
|
11.5
|
0.2
|
O3E
|
A:SIW301
|
4.0
|
9.0
|
0.2
|
O3E
|
A:SIW301
|
4.0
|
7.7
|
0.2
|
O3
|
A:SIW301
|
4.0
|
18.3
|
0.2
|
O3
|
A:SIW301
|
4.0
|
12.0
|
0.2
|
|
Silicon binding site 2 out
of 6 in 6qsg
Go back to
Silicon Binding Sites List in 6qsg
Silicon binding site 2 out
of 6 in the Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta)
Mono view
Stereo pair view
|
A full contact list of Silicon with other atoms in the Si binding
site number 2 of Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta) within 5.0Å range:
probe
|
atom
|
residue
|
distance (Å)
|
B
|
Occ
|
A:Si301
b:14.1
occ:0.25
|
SI1
|
A:SIW301
|
0.0
|
14.1
|
0.2
|
SI1
|
A:SIW301
|
0.0
|
6.4
|
0.2
|
O19E
|
A:SIW301
|
1.5
|
27.6
|
0.2
|
O19E
|
A:SIW301
|
1.5
|
27.9
|
0.2
|
O4
|
A:SIW301
|
1.5
|
21.2
|
0.2
|
O4
|
A:SIW301
|
1.5
|
27.1
|
0.2
|
O22
|
A:SIW301
|
1.7
|
11.1
|
0.2
|
O22
|
A:SIW301
|
1.7
|
14.2
|
0.2
|
O21
|
A:SIW301
|
1.7
|
23.2
|
0.2
|
O21
|
A:SIW301
|
1.7
|
25.6
|
0.2
|
W3E
|
A:SIW301
|
3.5
|
17.9
|
0.2
|
W4
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.3
|
0.2
|
W3E
|
A:SIW301
|
3.5
|
16.1
|
0.2
|
W5
|
A:SIW301
|
3.5
|
11.4
|
0.2
|
W6
|
A:SIW301
|
3.5
|
12.3
|
0.2
|
W2E
|
A:SIW301
|
3.5
|
11.3
|
0.2
|
W5E
|
A:SIW301
|
3.5
|
17.7
|
0.2
|
O18
|
A:SIW301
|
3.5
|
29.7
|
0.2
|
W5
|
A:SIW301
|
3.5
|
11.6
|
0.2
|
W2
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.5
|
0.2
|
W6
|
A:SIW301
|
3.5
|
11.7
|
0.2
|
W7
|
A:SIW301
|
3.5
|
10.4
|
0.2
|
W2E
|
A:SIW301
|
3.5
|
10.4
|
0.2
|
W2
|
A:SIW301
|
3.5
|
17.7
|
0.2
|
W4E
|
A:SIW301
|
3.5
|
11.1
|
0.2
|
W3
|
A:SIW301
|
3.5
|
11.5
|
0.2
|
W3
|
A:SIW301
|
3.5
|
11.6
|
0.2
|
W5E
|
A:SIW301
|
3.5
|
7.4
|
0.2
|
W1E
|
A:SIW301
|
3.5
|
6.9
|
0.2
|
O18
|
A:SIW301
|
3.5
|
26.0
|
0.2
|
W1E
|
A:SIW301
|
3.5
|
6.7
|
0.2
|
W7
|
A:SIW301
|
3.5
|
11.5
|
0.2
|
W4E
|
A:SIW301
|
3.5
|
10.7
|
0.2
|
W4
|
A:SIW301
|
3.6
|
6.7
|
0.2
|
W1
|
A:SIW301
|
3.6
|
7.0
|
0.2
|
O18E
|
A:SIW301
|
3.6
|
15.6
|
0.2
|
O18E
|
A:SIW301
|
3.6
|
13.4
|
0.2
|
O9E
|
A:SIW301
|
3.6
|
16.1
|
0.2
|
W1
|
A:SIW301
|
3.6
|
6.8
|
0.2
|
O9E
|
A:SIW301
|
3.6
|
16.8
|
0.2
|
O17
|
A:SIW301
|
3.6
|
5.2
|
0.2
|
O23
|
A:SIW301
|
3.6
|
4.6
|
0.2
|
O2E
|
A:SIW301
|
3.6
|
15.1
|
0.2
|
O17
|
A:SIW301
|
3.6
|
6.6
|
0.2
|
O9
|
A:SIW301
|
3.6
|
23.8
|
0.2
|
O2
|
A:SIW301
|
3.6
|
16.5
|
0.2
|
O16
|
A:SIW301
|
3.6
|
23.3
|
0.2
|
O17E
|
A:SIW301
|
3.6
|
21.1
|
0.2
|
O9
|
A:SIW301
|
3.6
|
17.9
|
0.2
|
O16
|
A:SIW301
|
3.6
|
25.8
|
0.2
|
O23
|
A:SIW301
|
3.6
|
5.5
|
0.2
|
O16E
|
A:SIW301
|
3.6
|
7.4
|
0.2
|
O8E
|
A:SIW301
|
3.7
|
16.8
|
0.2
|
O16E
|
A:SIW301
|
3.7
|
4.7
|
0.2
|
O2
|
A:SIW301
|
3.7
|
15.3
|
0.2
|
O17E
|
A:SIW301
|
3.7
|
24.8
|
0.2
|
O8
|
A:SIW301
|
3.7
|
11.3
|
0.2
|
O20E
|
A:SIW301
|
3.7
|
10.1
|
0.2
|
O8E
|
A:SIW301
|
3.7
|
13.6
|
0.2
|
O20E
|
A:SIW301
|
3.7
|
16.2
|
0.2
|
O2E
|
A:SIW301
|
3.7
|
10.5
|
0.2
|
O1E
|
A:SIW301
|
3.7
|
22.5
|
0.2
|
O8
|
A:SIW301
|
3.7
|
12.2
|
0.2
|
O20
|
A:SIW301
|
3.7
|
13.7
|
0.2
|
O20
|
A:SIW301
|
3.7
|
15.7
|
0.2
|
O23E
|
A:SIW301
|
3.7
|
17.1
|
0.2
|
O1E
|
A:SIW301
|
3.7
|
21.0
|
0.2
|
O1
|
A:SIW301
|
3.7
|
19.5
|
0.2
|
O1
|
A:SIW301
|
3.7
|
14.7
|
0.2
|
O23E
|
A:SIW301
|
3.8
|
15.8
|
0.2
|
O7E
|
A:SIW301
|
3.8
|
4.2
|
0.2
|
O7E
|
A:SIW301
|
3.8
|
6.5
|
0.2
|
O15
|
A:SIW301
|
3.8
|
21.4
|
0.2
|
O7
|
A:SIW301
|
3.9
|
11.2
|
0.2
|
O15
|
A:SIW301
|
3.9
|
16.3
|
0.2
|
O7
|
A:SIW301
|
3.9
|
16.5
|
0.2
|
O15E
|
A:SIW301
|
3.9
|
15.1
|
0.2
|
O15E
|
A:SIW301
|
3.9
|
11.5
|
0.2
|
O3E
|
A:SIW301
|
4.0
|
9.0
|
0.2
|
O3E
|
A:SIW301
|
4.0
|
7.7
|
0.2
|
O3
|
A:SIW301
|
4.0
|
18.3
|
0.2
|
O3
|
A:SIW301
|
4.0
|
12.0
|
0.2
|
|
Silicon binding site 3 out
of 6 in 6qsg
Go back to
Silicon Binding Sites List in 6qsg
Silicon binding site 3 out
of 6 in the Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta)
Mono view
Stereo pair view
|
A full contact list of Silicon with other atoms in the Si binding
site number 3 of Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta) within 5.0Å range:
probe
|
atom
|
residue
|
distance (Å)
|
B
|
Occ
|
A:Si302
b:31.2
occ:0.06
|
SI1
|
A:SIW302
|
0.0
|
31.2
|
0.1
|
SI1
|
A:SIW302
|
0.1
|
24.7
|
0.0
|
O22
|
A:SIW302
|
0.2
|
24.5
|
0.1
|
O22
|
A:SIW302
|
0.3
|
22.8
|
0.1
|
O4
|
A:SIW302
|
1.4
|
25.4
|
0.0
|
O19E
|
A:SIW302
|
1.5
|
32.1
|
0.1
|
O4
|
A:SIW302
|
1.5
|
31.0
|
0.1
|
O19E
|
A:SIW302
|
1.6
|
26.2
|
0.0
|
O21
|
A:SIW302
|
1.6
|
25.0
|
0.0
|
O22
|
A:SIW302
|
1.7
|
30.3
|
0.1
|
O22
|
A:SIW302
|
1.7
|
24.2
|
0.0
|
O21
|
A:SIW302
|
1.7
|
29.3
|
0.1
|
SI1
|
A:SIW302
|
1.7
|
23.9
|
0.1
|
SI1
|
A:SIW302
|
1.8
|
24.9
|
0.1
|
W5
|
A:SIW302
|
2.1
|
26.0
|
0.1
|
O17
|
A:SIW302
|
2.1
|
23.5
|
0.1
|
O23
|
A:SIW302
|
2.2
|
23.0
|
0.1
|
O23
|
A:SIW302
|
2.3
|
26.6
|
0.1
|
W6
|
A:SIW302
|
2.3
|
18.6
|
0.1
|
W3
|
A:SIW302
|
2.3
|
17.8
|
0.1
|
W5
|
A:SIW302
|
2.4
|
18.5
|
0.1
|
O19E
|
A:SIW302
|
2.4
|
23.4
|
0.1
|
O17
|
A:SIW302
|
2.4
|
25.0
|
0.1
|
O15
|
A:SIW302
|
2.5
|
28.9
|
0.1
|
O15
|
A:SIW302
|
2.5
|
23.7
|
0.1
|
W6
|
A:SIW302
|
2.5
|
19.7
|
0.1
|
O4
|
A:SIW302
|
2.6
|
23.0
|
0.1
|
W3
|
A:SIW302
|
2.6
|
20.1
|
0.1
|
O19E
|
A:SIW302
|
2.6
|
27.4
|
0.1
|
O21
|
A:SIW302
|
2.6
|
26.9
|
0.1
|
O4
|
A:SIW302
|
2.7
|
27.0
|
0.1
|
O21
|
A:SIW302
|
2.8
|
23.5
|
0.1
|
O20E
|
A:SIW302
|
2.8
|
24.5
|
0.1
|
O2
|
A:SIW302
|
2.9
|
24.8
|
0.1
|
O9
|
A:SIW302
|
3.0
|
23.2
|
0.1
|
O17E
|
A:SIW302
|
3.1
|
23.0
|
0.1
|
O17E
|
A:SIW302
|
3.1
|
23.8
|
0.1
|
O20E
|
A:SIW302
|
3.1
|
26.5
|
0.1
|
O2
|
A:SIW302
|
3.2
|
24.3
|
0.1
|
O1
|
A:SIW302
|
3.2
|
23.4
|
0.1
|
O23E
|
A:SIW302
|
3.2
|
24.8
|
0.1
|
O1
|
A:SIW302
|
3.3
|
24.6
|
0.1
|
O9
|
A:SIW302
|
3.4
|
26.4
|
0.1
|
W1
|
A:SIW302
|
3.4
|
36.7
|
0.0
|
W2
|
A:SIW302
|
3.5
|
28.0
|
0.0
|
O23E
|
A:SIW302
|
3.5
|
24.6
|
0.1
|
O18
|
A:SIW302
|
3.5
|
24.8
|
0.0
|
O9
|
A:SIW302
|
3.5
|
24.4
|
0.0
|
W3
|
A:SIW302
|
3.5
|
13.5
|
0.0
|
W7
|
A:SIW302
|
3.5
|
12.7
|
0.0
|
W4E
|
A:SIW302
|
3.5
|
11.9
|
0.0
|
W1
|
A:SIW302
|
3.5
|
11.2
|
0.1
|
W3E
|
A:SIW302
|
3.5
|
12.0
|
0.1
|
W4
|
A:SIW302
|
3.5
|
11.1
|
0.1
|
W6
|
A:SIW302
|
3.5
|
20.4
|
0.1
|
W2
|
A:SIW302
|
3.5
|
10.8
|
0.1
|
W5E
|
A:SIW302
|
3.5
|
11.5
|
0.1
|
W5E
|
A:SIW302
|
3.5
|
33.0
|
0.0
|
W7
|
A:SIW302
|
3.5
|
28.9
|
0.1
|
W1E
|
A:SIW302
|
3.5
|
11.4
|
0.1
|
W4
|
A:SIW302
|
3.5
|
32.8
|
0.0
|
W5
|
A:SIW302
|
3.5
|
21.7
|
0.1
|
O18E
|
A:SIW302
|
3.5
|
30.1
|
0.1
|
W4E
|
A:SIW302
|
3.5
|
35.0
|
0.1
|
W2E
|
A:SIW302
|
3.5
|
31.6
|
0.1
|
O18
|
A:SIW302
|
3.5
|
31.9
|
0.1
|
W3
|
A:SIW302
|
3.6
|
19.8
|
0.1
|
O8
|
A:SIW302
|
3.6
|
26.1
|
0.0
|
W5
|
A:SIW302
|
3.6
|
11.5
|
0.0
|
W6
|
A:SIW302
|
3.6
|
12.9
|
0.0
|
O9
|
A:SIW302
|
3.6
|
31.0
|
0.1
|
O9E
|
A:SIW302
|
3.6
|
31.9
|
0.1
|
O9E
|
A:SIW302
|
3.6
|
26.9
|
0.1
|
W2E
|
A:SIW302
|
3.6
|
11.8
|
0.0
|
O16E
|
A:SIW302
|
3.6
|
25.6
|
0.0
|
O20
|
A:SIW302
|
3.6
|
26.9
|
0.0
|
O18E
|
A:SIW302
|
3.6
|
26.4
|
0.0
|
W1E
|
A:SIW302
|
3.6
|
40.9
|
0.1
|
W1E
|
A:SIW302
|
3.6
|
34.7
|
0.0
|
O16
|
A:SIW302
|
3.6
|
31.6
|
0.1
|
W3E
|
A:SIW302
|
3.6
|
36.9
|
0.0
|
O16
|
A:SIW302
|
3.6
|
25.1
|
0.0
|
O17
|
A:SIW302
|
3.6
|
25.6
|
0.0
|
O17E
|
A:SIW302
|
3.6
|
31.6
|
0.1
|
O16E
|
A:SIW302
|
3.6
|
33.4
|
0.1
|
O20E
|
A:SIW302
|
3.6
|
32.4
|
0.1
|
O2E
|
A:SIW302
|
3.6
|
25.6
|
0.0
|
O2E
|
A:SIW302
|
3.7
|
31.5
|
0.1
|
O20
|
A:SIW302
|
3.7
|
31.6
|
0.1
|
O17
|
A:SIW302
|
3.7
|
31.5
|
0.1
|
O2
|
A:SIW302
|
3.7
|
30.8
|
0.1
|
O1
|
A:SIW302
|
3.7
|
25.2
|
0.0
|
O8
|
A:SIW302
|
3.7
|
28.3
|
0.1
|
O2
|
A:SIW302
|
3.7
|
26.0
|
0.0
|
O9E
|
A:SIW302
|
3.7
|
27.2
|
0.0
|
O8E
|
A:SIW302
|
3.7
|
33.1
|
0.1
|
W4
|
A:SIW302
|
3.7
|
43.5
|
0.1
|
O23E
|
A:SIW302
|
3.7
|
31.3
|
0.1
|
O23
|
A:SIW302
|
3.7
|
31.9
|
0.1
|
O1E
|
A:SIW302
|
3.7
|
33.4
|
0.1
|
O17E
|
A:SIW302
|
3.7
|
25.3
|
0.0
|
O23E
|
A:SIW302
|
3.7
|
26.6
|
0.0
|
O20E
|
A:SIW302
|
3.7
|
26.2
|
0.0
|
O13
|
A:SIW302
|
3.7
|
24.0
|
0.1
|
O1
|
A:SIW302
|
3.7
|
30.1
|
0.1
|
O23
|
A:SIW302
|
3.7
|
26.8
|
0.0
|
O8E
|
A:SIW302
|
3.8
|
26.1
|
0.0
|
O18E
|
A:SIW302
|
3.8
|
25.6
|
0.1
|
O7
|
A:SIW302
|
3.8
|
24.8
|
0.0
|
O5
|
A:SIW302
|
3.8
|
30.1
|
0.1
|
O1E
|
A:SIW302
|
3.8
|
25.3
|
0.0
|
O20
|
A:SIW302
|
3.8
|
24.9
|
0.1
|
O9E
|
A:SIW302
|
3.8
|
25.5
|
0.1
|
O7
|
A:SIW302
|
3.9
|
31.4
|
0.1
|
O7E
|
A:SIW302
|
3.9
|
25.4
|
0.0
|
O7E
|
A:SIW302
|
3.9
|
33.4
|
0.1
|
W3E
|
A:SIW302
|
3.9
|
39.2
|
0.1
|
O11
|
A:SIW302
|
3.9
|
29.5
|
0.1
|
O15E
|
A:SIW302
|
3.9
|
30.0
|
0.1
|
O13
|
A:SIW302
|
3.9
|
30.5
|
0.1
|
O15
|
A:SIW302
|
3.9
|
26.2
|
0.0
|
W5E
|
A:SIW302
|
3.9
|
11.5
|
0.1
|
O15
|
A:SIW302
|
3.9
|
33.3
|
0.1
|
W1
|
A:SIW302
|
3.9
|
11.2
|
0.1
|
W3E
|
A:SIW302
|
3.9
|
11.5
|
0.1
|
O5
|
A:SIW302
|
4.0
|
22.9
|
0.1
|
W2
|
A:SIW302
|
4.0
|
10.3
|
0.1
|
O3
|
A:SIW302
|
4.0
|
25.6
|
0.0
|
W1E
|
A:SIW302
|
4.0
|
10.9
|
0.1
|
O15E
|
A:SIW302
|
4.0
|
26.1
|
0.0
|
W4
|
A:SIW302
|
4.0
|
10.8
|
0.1
|
W2
|
A:SIW302
|
4.0
|
41.9
|
0.1
|
O3
|
A:SIW302
|
4.0
|
29.4
|
0.1
|
O3E
|
A:SIW302
|
4.0
|
33.4
|
0.1
|
O3E
|
A:SIW302
|
4.0
|
26.1
|
0.0
|
O11
|
A:SIW302
|
4.1
|
23.1
|
0.1
|
O20
|
A:SIW302
|
4.1
|
28.4
|
0.1
|
O3
|
A:SIW302
|
4.1
|
27.7
|
0.1
|
W5E
|
A:SIW302
|
4.2
|
44.2
|
0.1
|
O18E
|
A:SIW302
|
4.2
|
23.6
|
0.1
|
W1
|
A:SIW302
|
4.2
|
43.8
|
0.1
|
O3
|
A:SIW302
|
4.3
|
20.6
|
0.1
|
O8
|
A:SIW302
|
4.3
|
21.3
|
0.1
|
O15E
|
A:SIW302
|
4.4
|
23.4
|
0.1
|
O8
|
A:SIW302
|
4.4
|
27.1
|
0.1
|
O15E
|
A:SIW302
|
4.5
|
25.1
|
0.1
|
O8E
|
A:SIW302
|
4.6
|
24.3
|
0.1
|
O16
|
A:SIW302
|
4.6
|
25.4
|
0.1
|
O18
|
A:SIW302
|
4.7
|
23.7
|
0.1
|
O1E
|
A:SIW302
|
4.7
|
24.7
|
0.1
|
O2E
|
A:SIW302
|
4.8
|
21.6
|
0.1
|
O16
|
A:SIW302
|
4.8
|
22.6
|
0.1
|
O1E
|
A:SIW302
|
4.8
|
25.2
|
0.1
|
O8E
|
A:SIW302
|
4.8
|
25.8
|
0.1
|
O18
|
A:SIW302
|
4.9
|
24.1
|
0.1
|
O2E
|
A:SIW302
|
4.9
|
26.3
|
0.1
|
O7
|
A:SIW302
|
4.9
|
27.1
|
0.1
|
W2E
|
A:SIW302
|
4.9
|
27.7
|
0.1
|
O7
|
A:SIW302
|
5.0
|
22.1
|
0.1
|
W7
|
A:SIW302
|
5.0
|
35.5
|
0.1
|
|
Silicon binding site 4 out
of 6 in 6qsg
Go back to
Silicon Binding Sites List in 6qsg
Silicon binding site 4 out
of 6 in the Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta)
Mono view
Stereo pair view
|
A full contact list of Silicon with other atoms in the Si binding
site number 4 of Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta) within 5.0Å range:
probe
|
atom
|
residue
|
distance (Å)
|
B
|
Occ
|
A:Si302
b:24.7
occ:0.03
|
SI1
|
A:SIW302
|
0.0
|
24.7
|
0.0
|
SI1
|
A:SIW302
|
0.1
|
31.2
|
0.1
|
O22
|
A:SIW302
|
0.1
|
24.5
|
0.1
|
O22
|
A:SIW302
|
0.3
|
22.8
|
0.1
|
O19E
|
A:SIW302
|
1.4
|
32.1
|
0.1
|
O4
|
A:SIW302
|
1.4
|
31.0
|
0.1
|
O19E
|
A:SIW302
|
1.5
|
26.2
|
0.0
|
O4
|
A:SIW302
|
1.5
|
25.4
|
0.0
|
O22
|
A:SIW302
|
1.7
|
24.2
|
0.0
|
O22
|
A:SIW302
|
1.7
|
30.3
|
0.1
|
O21
|
A:SIW302
|
1.7
|
25.0
|
0.0
|
SI1
|
A:SIW302
|
1.7
|
23.9
|
0.1
|
SI1
|
A:SIW302
|
1.8
|
24.9
|
0.1
|
O21
|
A:SIW302
|
1.8
|
29.3
|
0.1
|
W5
|
A:SIW302
|
2.1
|
26.0
|
0.1
|
O23
|
A:SIW302
|
2.1
|
23.0
|
0.1
|
O17
|
A:SIW302
|
2.2
|
23.5
|
0.1
|
O23
|
A:SIW302
|
2.2
|
26.6
|
0.1
|
W5
|
A:SIW302
|
2.3
|
18.5
|
0.1
|
W3
|
A:SIW302
|
2.3
|
17.8
|
0.1
|
O19E
|
A:SIW302
|
2.3
|
23.4
|
0.1
|
W6
|
A:SIW302
|
2.4
|
18.6
|
0.1
|
O15
|
A:SIW302
|
2.4
|
28.9
|
0.1
|
W6
|
A:SIW302
|
2.5
|
19.7
|
0.1
|
O15
|
A:SIW302
|
2.5
|
23.7
|
0.1
|
O17
|
A:SIW302
|
2.5
|
25.0
|
0.1
|
O19E
|
A:SIW302
|
2.6
|
27.4
|
0.1
|
O4
|
A:SIW302
|
2.6
|
23.0
|
0.1
|
O21
|
A:SIW302
|
2.6
|
26.9
|
0.1
|
W3
|
A:SIW302
|
2.7
|
20.1
|
0.1
|
O20E
|
A:SIW302
|
2.7
|
24.5
|
0.1
|
O21
|
A:SIW302
|
2.7
|
23.5
|
0.1
|
O4
|
A:SIW302
|
2.8
|
27.0
|
0.1
|
O2
|
A:SIW302
|
2.8
|
24.8
|
0.1
|
O2
|
A:SIW302
|
3.1
|
24.3
|
0.1
|
O17E
|
A:SIW302
|
3.1
|
23.8
|
0.1
|
O20E
|
A:SIW302
|
3.1
|
26.5
|
0.1
|
O9
|
A:SIW302
|
3.1
|
23.2
|
0.1
|
O1
|
A:SIW302
|
3.2
|
23.4
|
0.1
|
O17E
|
A:SIW302
|
3.2
|
23.0
|
0.1
|
O23E
|
A:SIW302
|
3.3
|
24.8
|
0.1
|
O1
|
A:SIW302
|
3.4
|
24.6
|
0.1
|
W3E
|
A:SIW302
|
3.4
|
12.0
|
0.1
|
W5E
|
A:SIW302
|
3.4
|
11.5
|
0.1
|
O9
|
A:SIW302
|
3.5
|
26.4
|
0.1
|
W6
|
A:SIW302
|
3.5
|
20.4
|
0.1
|
O9E
|
A:SIW302
|
3.5
|
26.9
|
0.1
|
W2E
|
A:SIW302
|
3.5
|
31.6
|
0.1
|
W4E
|
A:SIW302
|
3.5
|
35.0
|
0.1
|
W7
|
A:SIW302
|
3.5
|
12.7
|
0.0
|
W2E
|
A:SIW302
|
3.5
|
11.8
|
0.0
|
O9E
|
A:SIW302
|
3.5
|
31.9
|
0.1
|
W1E
|
A:SIW302
|
3.5
|
40.9
|
0.1
|
W1
|
A:SIW302
|
3.5
|
36.7
|
0.0
|
W1
|
A:SIW302
|
3.5
|
11.2
|
0.1
|
W2
|
A:SIW302
|
3.5
|
28.0
|
0.0
|
W5E
|
A:SIW302
|
3.5
|
33.0
|
0.0
|
O23E
|
A:SIW302
|
3.5
|
24.6
|
0.1
|
W4
|
A:SIW302
|
3.5
|
32.8
|
0.0
|
W1E
|
A:SIW302
|
3.5
|
11.4
|
0.1
|
W1E
|
A:SIW302
|
3.5
|
34.7
|
0.0
|
W4E
|
A:SIW302
|
3.5
|
11.9
|
0.0
|
W5
|
A:SIW302
|
3.5
|
11.5
|
0.0
|
O18E
|
A:SIW302
|
3.5
|
26.4
|
0.0
|
W6
|
A:SIW302
|
3.5
|
12.9
|
0.0
|
W3E
|
A:SIW302
|
3.5
|
36.9
|
0.0
|
O18
|
A:SIW302
|
3.5
|
31.9
|
0.1
|
W3
|
A:SIW302
|
3.6
|
13.5
|
0.0
|
O18
|
A:SIW302
|
3.6
|
24.8
|
0.0
|
O17E
|
A:SIW302
|
3.6
|
31.6
|
0.1
|
W5
|
A:SIW302
|
3.6
|
21.7
|
0.1
|
O9
|
A:SIW302
|
3.6
|
24.4
|
0.0
|
O9E
|
A:SIW302
|
3.6
|
27.2
|
0.0
|
O2E
|
A:SIW302
|
3.6
|
31.5
|
0.1
|
W3
|
A:SIW302
|
3.6
|
19.8
|
0.1
|
O9
|
A:SIW302
|
3.6
|
31.0
|
0.1
|
O18E
|
A:SIW302
|
3.6
|
30.1
|
0.1
|
W7
|
A:SIW302
|
3.6
|
28.9
|
0.1
|
W4
|
A:SIW302
|
3.6
|
11.1
|
0.1
|
O20
|
A:SIW302
|
3.6
|
31.6
|
0.1
|
W2
|
A:SIW302
|
3.6
|
10.8
|
0.1
|
O23E
|
A:SIW302
|
3.6
|
31.3
|
0.1
|
O16E
|
A:SIW302
|
3.6
|
25.6
|
0.0
|
O16
|
A:SIW302
|
3.6
|
25.1
|
0.0
|
O17
|
A:SIW302
|
3.6
|
31.5
|
0.1
|
O1E
|
A:SIW302
|
3.6
|
33.4
|
0.1
|
O20
|
A:SIW302
|
3.6
|
26.9
|
0.0
|
O17E
|
A:SIW302
|
3.6
|
25.3
|
0.0
|
O20E
|
A:SIW302
|
3.6
|
26.2
|
0.0
|
O20E
|
A:SIW302
|
3.6
|
32.4
|
0.1
|
O2
|
A:SIW302
|
3.6
|
26.0
|
0.0
|
O2E
|
A:SIW302
|
3.7
|
25.6
|
0.0
|
O8
|
A:SIW302
|
3.7
|
26.1
|
0.0
|
O17
|
A:SIW302
|
3.7
|
25.6
|
0.0
|
W4
|
A:SIW302
|
3.7
|
43.5
|
0.1
|
O13
|
A:SIW302
|
3.7
|
24.0
|
0.1
|
O16E
|
A:SIW302
|
3.7
|
33.4
|
0.1
|
O8E
|
A:SIW302
|
3.7
|
33.1
|
0.1
|
O8E
|
A:SIW302
|
3.7
|
26.1
|
0.0
|
O23
|
A:SIW302
|
3.7
|
31.9
|
0.1
|
O16
|
A:SIW302
|
3.7
|
31.6
|
0.1
|
O23
|
A:SIW302
|
3.7
|
26.8
|
0.0
|
O8
|
A:SIW302
|
3.7
|
28.3
|
0.1
|
O23E
|
A:SIW302
|
3.7
|
26.6
|
0.0
|
O18E
|
A:SIW302
|
3.7
|
25.6
|
0.1
|
O2
|
A:SIW302
|
3.7
|
30.8
|
0.1
|
O1E
|
A:SIW302
|
3.7
|
25.3
|
0.0
|
O1
|
A:SIW302
|
3.7
|
25.2
|
0.0
|
O1
|
A:SIW302
|
3.8
|
30.1
|
0.1
|
O15E
|
A:SIW302
|
3.8
|
30.0
|
0.1
|
O9E
|
A:SIW302
|
3.8
|
25.5
|
0.1
|
W3E
|
A:SIW302
|
3.8
|
39.2
|
0.1
|
O7E
|
A:SIW302
|
3.8
|
25.4
|
0.0
|
O13
|
A:SIW302
|
3.9
|
30.5
|
0.1
|
O7
|
A:SIW302
|
3.9
|
24.8
|
0.0
|
O5
|
A:SIW302
|
3.9
|
30.1
|
0.1
|
O11
|
A:SIW302
|
3.9
|
29.5
|
0.1
|
O7E
|
A:SIW302
|
3.9
|
33.4
|
0.1
|
O20
|
A:SIW302
|
3.9
|
24.9
|
0.1
|
W4
|
A:SIW302
|
3.9
|
10.8
|
0.1
|
W2
|
A:SIW302
|
3.9
|
10.3
|
0.1
|
W1E
|
A:SIW302
|
3.9
|
10.9
|
0.1
|
O15
|
A:SIW302
|
3.9
|
26.2
|
0.0
|
O7
|
A:SIW302
|
3.9
|
31.4
|
0.1
|
O15E
|
A:SIW302
|
3.9
|
26.1
|
0.0
|
O5
|
A:SIW302
|
4.0
|
22.9
|
0.1
|
O3E
|
A:SIW302
|
4.0
|
33.4
|
0.1
|
O15
|
A:SIW302
|
4.0
|
33.3
|
0.1
|
W1
|
A:SIW302
|
4.0
|
11.2
|
0.1
|
W3E
|
A:SIW302
|
4.0
|
11.5
|
0.1
|
O3E
|
A:SIW302
|
4.0
|
26.1
|
0.0
|
W5E
|
A:SIW302
|
4.0
|
11.5
|
0.1
|
O3
|
A:SIW302
|
4.0
|
25.6
|
0.0
|
W2
|
A:SIW302
|
4.1
|
41.9
|
0.1
|
O18E
|
A:SIW302
|
4.1
|
23.6
|
0.1
|
O3
|
A:SIW302
|
4.1
|
29.4
|
0.1
|
O3
|
A:SIW302
|
4.1
|
27.7
|
0.1
|
O3
|
A:SIW302
|
4.2
|
20.6
|
0.1
|
W5E
|
A:SIW302
|
4.2
|
44.2
|
0.1
|
O11
|
A:SIW302
|
4.2
|
23.1
|
0.1
|
O20
|
A:SIW302
|
4.2
|
28.4
|
0.1
|
O8
|
A:SIW302
|
4.3
|
21.3
|
0.1
|
W1
|
A:SIW302
|
4.3
|
43.8
|
0.1
|
O8E
|
A:SIW302
|
4.5
|
24.3
|
0.1
|
O15E
|
A:SIW302
|
4.5
|
23.4
|
0.1
|
O8
|
A:SIW302
|
4.5
|
27.1
|
0.1
|
O15E
|
A:SIW302
|
4.5
|
25.1
|
0.1
|
O16
|
A:SIW302
|
4.6
|
25.4
|
0.1
|
O1E
|
A:SIW302
|
4.7
|
24.7
|
0.1
|
O16
|
A:SIW302
|
4.8
|
22.6
|
0.1
|
O18
|
A:SIW302
|
4.8
|
23.7
|
0.1
|
O8E
|
A:SIW302
|
4.8
|
25.8
|
0.1
|
O2E
|
A:SIW302
|
4.8
|
21.6
|
0.1
|
O1E
|
A:SIW302
|
4.9
|
25.2
|
0.1
|
W2E
|
A:SIW302
|
4.9
|
27.7
|
0.1
|
O7
|
A:SIW302
|
4.9
|
22.1
|
0.1
|
O18
|
A:SIW302
|
4.9
|
24.1
|
0.1
|
O2E
|
A:SIW302
|
4.9
|
26.3
|
0.1
|
O7
|
A:SIW302
|
5.0
|
27.1
|
0.1
|
W7
|
A:SIW302
|
5.0
|
35.5
|
0.1
|
|
Silicon binding site 5 out
of 6 in 6qsg
Go back to
Silicon Binding Sites List in 6qsg
Silicon binding site 5 out
of 6 in the Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta)
Mono view
Stereo pair view
|
A full contact list of Silicon with other atoms in the Si binding
site number 5 of Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta) within 5.0Å range:
probe
|
atom
|
residue
|
distance (Å)
|
B
|
Occ
|
A:Si302
b:24.9
occ:0.05
|
SI1
|
A:SIW302
|
0.0
|
24.9
|
0.1
|
O22
|
A:SIW302
|
0.2
|
24.2
|
0.0
|
O22
|
A:SIW302
|
0.2
|
30.3
|
0.1
|
SI1
|
A:SIW302
|
0.4
|
23.9
|
0.1
|
O19E
|
A:SIW302
|
1.2
|
23.4
|
0.1
|
O19E
|
A:SIW302
|
1.5
|
27.4
|
0.1
|
O4
|
A:SIW302
|
1.5
|
23.0
|
0.1
|
O21
|
A:SIW302
|
1.6
|
26.9
|
0.1
|
O22
|
A:SIW302
|
1.7
|
24.5
|
0.1
|
O21
|
A:SIW302
|
1.7
|
23.5
|
0.1
|
SI1
|
A:SIW302
|
1.8
|
24.7
|
0.0
|
SI1
|
A:SIW302
|
1.8
|
31.2
|
0.1
|
O22
|
A:SIW302
|
1.8
|
22.8
|
0.1
|
O4
|
A:SIW302
|
1.8
|
27.0
|
0.1
|
O17
|
A:SIW302
|
2.1
|
25.6
|
0.0
|
O17
|
A:SIW302
|
2.2
|
31.5
|
0.1
|
O23
|
A:SIW302
|
2.2
|
31.9
|
0.1
|
O23
|
A:SIW302
|
2.3
|
26.8
|
0.0
|
W6
|
A:SIW302
|
2.3
|
20.4
|
0.1
|
W3
|
A:SIW302
|
2.3
|
13.5
|
0.0
|
W5
|
A:SIW302
|
2.3
|
21.7
|
0.1
|
W6
|
A:SIW302
|
2.3
|
12.9
|
0.0
|
W3
|
A:SIW302
|
2.4
|
19.8
|
0.1
|
W5
|
A:SIW302
|
2.4
|
11.5
|
0.0
|
O15
|
A:SIW302
|
2.4
|
26.2
|
0.0
|
O15
|
A:SIW302
|
2.5
|
33.3
|
0.1
|
O4
|
A:SIW302
|
2.6
|
25.4
|
0.0
|
O4
|
A:SIW302
|
2.6
|
31.0
|
0.1
|
O19E
|
A:SIW302
|
2.6
|
32.1
|
0.1
|
O19E
|
A:SIW302
|
2.6
|
26.2
|
0.0
|
O21
|
A:SIW302
|
2.7
|
25.0
|
0.0
|
O21
|
A:SIW302
|
2.8
|
29.3
|
0.1
|
O9
|
A:SIW302
|
3.0
|
24.4
|
0.0
|
O9
|
A:SIW302
|
3.1
|
31.0
|
0.1
|
O17E
|
A:SIW302
|
3.1
|
31.6
|
0.1
|
O20E
|
A:SIW302
|
3.1
|
32.4
|
0.1
|
O2
|
A:SIW302
|
3.1
|
26.0
|
0.0
|
O17E
|
A:SIW302
|
3.1
|
25.3
|
0.0
|
O2
|
A:SIW302
|
3.1
|
30.8
|
0.1
|
O1
|
A:SIW302
|
3.2
|
25.2
|
0.0
|
O20E
|
A:SIW302
|
3.2
|
26.2
|
0.0
|
O18E
|
A:SIW302
|
3.2
|
25.6
|
0.1
|
W1E
|
A:SIW302
|
3.2
|
40.9
|
0.1
|
O23E
|
A:SIW302
|
3.2
|
31.3
|
0.1
|
O1
|
A:SIW302
|
3.2
|
30.1
|
0.1
|
O23E
|
A:SIW302
|
3.3
|
26.6
|
0.0
|
W4
|
A:SIW302
|
3.3
|
43.5
|
0.1
|
O8E
|
A:SIW302
|
3.4
|
24.3
|
0.1
|
W2E
|
A:SIW302
|
3.4
|
27.7
|
0.1
|
O16
|
A:SIW302
|
3.4
|
25.4
|
0.1
|
O9E
|
A:SIW302
|
3.4
|
26.9
|
0.1
|
W7
|
A:SIW302
|
3.4
|
35.5
|
0.1
|
O20E
|
A:SIW302
|
3.4
|
24.5
|
0.1
|
W5
|
A:SIW302
|
3.4
|
26.0
|
0.1
|
O2
|
A:SIW302
|
3.5
|
24.8
|
0.1
|
W3E
|
A:SIW302
|
3.5
|
39.2
|
0.1
|
W7
|
A:SIW302
|
3.5
|
23.9
|
0.1
|
W2
|
A:SIW302
|
3.5
|
10.3
|
0.1
|
W2E
|
A:SIW302
|
3.5
|
19.8
|
0.1
|
W1
|
A:SIW302
|
3.5
|
11.2
|
0.1
|
W5
|
A:SIW302
|
3.5
|
18.5
|
0.1
|
W4
|
A:SIW302
|
3.5
|
10.8
|
0.1
|
W1E
|
A:SIW302
|
3.5
|
10.9
|
0.1
|
W4E
|
A:SIW302
|
3.5
|
21.1
|
0.1
|
W3
|
A:SIW302
|
3.5
|
17.8
|
0.1
|
W6
|
A:SIW302
|
3.5
|
18.6
|
0.1
|
W5E
|
A:SIW302
|
3.5
|
11.5
|
0.1
|
O18E
|
A:SIW302
|
3.5
|
23.6
|
0.1
|
W3E
|
A:SIW302
|
3.5
|
11.5
|
0.1
|
O18
|
A:SIW302
|
3.6
|
23.7
|
0.1
|
O9
|
A:SIW302
|
3.6
|
23.2
|
0.1
|
O9E
|
A:SIW302
|
3.6
|
25.5
|
0.1
|
W2
|
A:SIW302
|
3.6
|
41.9
|
0.1
|
O16
|
A:SIW302
|
3.6
|
22.6
|
0.1
|
O1E
|
A:SIW302
|
3.6
|
24.7
|
0.1
|
O16E
|
A:SIW302
|
3.6
|
25.5
|
0.1
|
O7E
|
A:SIW302
|
3.6
|
25.3
|
0.1
|
O20
|
A:SIW302
|
3.6
|
24.9
|
0.1
|
O2E
|
A:SIW302
|
3.7
|
21.6
|
0.1
|
O20E
|
A:SIW302
|
3.7
|
26.5
|
0.1
|
O16E
|
A:SIW302
|
3.7
|
26.0
|
0.1
|
O17
|
A:SIW302
|
3.7
|
23.5
|
0.1
|
O2
|
A:SIW302
|
3.7
|
24.3
|
0.1
|
O8
|
A:SIW302
|
3.7
|
21.3
|
0.1
|
W4E
|
A:SIW302
|
3.7
|
26.2
|
0.1
|
O17E
|
A:SIW302
|
3.7
|
23.0
|
0.1
|
O8E
|
A:SIW302
|
3.7
|
25.8
|
0.1
|
W6
|
A:SIW302
|
3.7
|
19.7
|
0.1
|
O17E
|
A:SIW302
|
3.7
|
23.8
|
0.1
|
O23
|
A:SIW302
|
3.7
|
26.6
|
0.1
|
O1E
|
A:SIW302
|
3.7
|
25.2
|
0.1
|
O1
|
A:SIW302
|
3.7
|
23.4
|
0.1
|
O23E
|
A:SIW302
|
3.7
|
24.8
|
0.1
|
O23
|
A:SIW302
|
3.7
|
23.0
|
0.1
|
W3
|
A:SIW302
|
3.8
|
20.1
|
0.1
|
O5
|
A:SIW302
|
3.8
|
33.9
|
0.1
|
O18
|
A:SIW302
|
3.8
|
24.1
|
0.1
|
O9E
|
A:SIW302
|
3.8
|
31.9
|
0.1
|
O20
|
A:SIW302
|
3.8
|
26.9
|
0.0
|
W5E
|
A:SIW302
|
3.8
|
44.2
|
0.1
|
O20
|
A:SIW302
|
3.8
|
31.6
|
0.1
|
O5
|
A:SIW302
|
3.8
|
26.2
|
0.0
|
O7
|
A:SIW302
|
3.8
|
22.1
|
0.1
|
O7
|
A:SIW302
|
3.8
|
27.1
|
0.1
|
O11
|
A:SIW302
|
3.9
|
25.2
|
0.0
|
O7E
|
A:SIW302
|
3.9
|
27.8
|
0.1
|
W1
|
A:SIW302
|
3.9
|
43.8
|
0.1
|
O2E
|
A:SIW302
|
3.9
|
26.3
|
0.1
|
O1
|
A:SIW302
|
3.9
|
24.6
|
0.1
|
O17
|
A:SIW302
|
3.9
|
25.0
|
0.1
|
O9E
|
A:SIW302
|
3.9
|
27.2
|
0.0
|
O9
|
A:SIW302
|
3.9
|
26.4
|
0.1
|
W1
|
A:SIW302
|
3.9
|
36.7
|
0.0
|
O8
|
A:SIW302
|
3.9
|
27.1
|
0.1
|
O13
|
A:SIW302
|
3.9
|
33.6
|
0.1
|
O11
|
A:SIW302
|
3.9
|
34.2
|
0.1
|
W3E
|
A:SIW302
|
3.9
|
12.0
|
0.1
|
W2
|
A:SIW302
|
3.9
|
28.0
|
0.0
|
O15
|
A:SIW302
|
3.9
|
28.9
|
0.1
|
O13
|
A:SIW302
|
3.9
|
26.1
|
0.0
|
W5E
|
A:SIW302
|
3.9
|
11.5
|
0.1
|
O3
|
A:SIW302
|
3.9
|
27.7
|
0.1
|
O15E
|
A:SIW302
|
3.9
|
23.4
|
0.1
|
W1
|
A:SIW302
|
3.9
|
11.2
|
0.1
|
W5E
|
A:SIW302
|
3.9
|
33.0
|
0.0
|
W1E
|
A:SIW302
|
4.0
|
11.4
|
0.1
|
O23E
|
A:SIW302
|
4.0
|
24.6
|
0.1
|
W4
|
A:SIW302
|
4.0
|
32.8
|
0.0
|
W4
|
A:SIW302
|
4.0
|
11.1
|
0.1
|
W2
|
A:SIW302
|
4.0
|
10.8
|
0.1
|
O15
|
A:SIW302
|
4.0
|
23.7
|
0.1
|
O3E
|
A:SIW302
|
4.0
|
24.2
|
0.1
|
O3
|
A:SIW302
|
4.0
|
20.6
|
0.1
|
W3E
|
A:SIW302
|
4.0
|
36.9
|
0.0
|
O20
|
A:SIW302
|
4.0
|
28.4
|
0.1
|
W1E
|
A:SIW302
|
4.0
|
34.7
|
0.0
|
O3E
|
A:SIW302
|
4.0
|
29.3
|
0.1
|
O15E
|
A:SIW302
|
4.1
|
25.1
|
0.1
|
O18E
|
A:SIW302
|
4.1
|
30.1
|
0.1
|
O18E
|
A:SIW302
|
4.2
|
26.4
|
0.0
|
O8
|
A:SIW302
|
4.2
|
26.1
|
0.0
|
O3
|
A:SIW302
|
4.2
|
25.6
|
0.0
|
O3
|
A:SIW302
|
4.3
|
29.4
|
0.1
|
O8
|
A:SIW302
|
4.3
|
28.3
|
0.1
|
O15E
|
A:SIW302
|
4.4
|
30.0
|
0.1
|
O15E
|
A:SIW302
|
4.5
|
26.1
|
0.0
|
O18
|
A:SIW302
|
4.7
|
24.8
|
0.0
|
O18
|
A:SIW302
|
4.7
|
31.9
|
0.1
|
O2E
|
A:SIW302
|
4.8
|
31.5
|
0.1
|
O2E
|
A:SIW302
|
4.8
|
25.6
|
0.0
|
O16
|
A:SIW302
|
4.8
|
25.1
|
0.0
|
O12E
|
A:SIW302
|
4.8
|
23.7
|
0.1
|
O16
|
A:SIW302
|
4.8
|
31.6
|
0.1
|
O1E
|
A:SIW302
|
4.8
|
33.4
|
0.1
|
O8E
|
A:SIW302
|
4.8
|
33.1
|
0.1
|
O8E
|
A:SIW302
|
4.9
|
26.1
|
0.0
|
O1E
|
A:SIW302
|
4.9
|
25.3
|
0.0
|
O14
|
A:SIW302
|
4.9
|
25.5
|
0.1
|
O7
|
A:SIW302
|
4.9
|
24.8
|
0.0
|
O7
|
A:SIW302
|
5.0
|
31.4
|
0.1
|
|
Silicon binding site 6 out
of 6 in 6qsg
Go back to
Silicon Binding Sites List in 6qsg
Silicon binding site 6 out
of 6 in the Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta)
Mono view
Stereo pair view
|
A full contact list of Silicon with other atoms in the Si binding
site number 6 of Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta) within 5.0Å range:
probe
|
atom
|
residue
|
distance (Å)
|
B
|
Occ
|
A:Si302
b:23.9
occ:0.05
|
SI1
|
A:SIW302
|
0.0
|
23.9
|
0.1
|
O22
|
A:SIW302
|
0.2
|
30.3
|
0.1
|
SI1
|
A:SIW302
|
0.4
|
24.9
|
0.1
|
O22
|
A:SIW302
|
0.4
|
24.2
|
0.0
|
O4
|
A:SIW302
|
1.4
|
23.0
|
0.1
|
O19E
|
A:SIW302
|
1.4
|
27.4
|
0.1
|
O19E
|
A:SIW302
|
1.5
|
23.4
|
0.1
|
O4
|
A:SIW302
|
1.5
|
27.0
|
0.1
|
O22
|
A:SIW302
|
1.7
|
24.5
|
0.1
|
O22
|
A:SIW302
|
1.7
|
22.8
|
0.1
|
O21
|
A:SIW302
|
1.7
|
26.9
|
0.1
|
SI1
|
A:SIW302
|
1.7
|
31.2
|
0.1
|
SI1
|
A:SIW302
|
1.7
|
24.7
|
0.0
|
O21
|
A:SIW302
|
2.1
|
23.5
|
0.1
|
W3
|
A:SIW302
|
2.1
|
13.5
|
0.0
|
W5
|
A:SIW302
|
2.2
|
21.7
|
0.1
|
O17
|
A:SIW302
|
2.2
|
25.6
|
0.0
|
O15
|
A:SIW302
|
2.3
|
33.3
|
0.1
|
O23
|
A:SIW302
|
2.3
|
31.9
|
0.1
|
O15
|
A:SIW302
|
2.4
|
26.2
|
0.0
|
W3
|
A:SIW302
|
2.4
|
19.8
|
0.1
|
O17
|
A:SIW302
|
2.4
|
31.5
|
0.1
|
O4
|
A:SIW302
|
2.5
|
25.4
|
0.0
|
O21
|
A:SIW302
|
2.5
|
29.3
|
0.1
|
W5
|
A:SIW302
|
2.5
|
11.5
|
0.0
|
O21
|
A:SIW302
|
2.5
|
25.0
|
0.0
|
O19E
|
A:SIW302
|
2.5
|
32.1
|
0.1
|
O23
|
A:SIW302
|
2.6
|
26.8
|
0.0
|
W6
|
A:SIW302
|
2.6
|
20.4
|
0.1
|
W6
|
A:SIW302
|
2.6
|
12.9
|
0.0
|
O4
|
A:SIW302
|
2.7
|
31.0
|
0.1
|
O19E
|
A:SIW302
|
2.7
|
26.2
|
0.0
|
O9
|
A:SIW302
|
2.8
|
24.4
|
0.0
|
O1
|
A:SIW302
|
2.8
|
25.2
|
0.0
|
O2
|
A:SIW302
|
2.8
|
30.8
|
0.1
|
O20E
|
A:SIW302
|
3.0
|
32.4
|
0.1
|
O1
|
A:SIW302
|
3.0
|
30.1
|
0.1
|
O2
|
A:SIW302
|
3.1
|
26.0
|
0.0
|
O9
|
A:SIW302
|
3.2
|
31.0
|
0.1
|
W5E
|
A:SIW302
|
3.2
|
11.5
|
0.1
|
W3E
|
A:SIW302
|
3.3
|
11.5
|
0.1
|
W6
|
A:SIW302
|
3.3
|
18.6
|
0.1
|
O17E
|
A:SIW302
|
3.3
|
31.6
|
0.1
|
O17E
|
A:SIW302
|
3.4
|
23.0
|
0.1
|
O23E
|
A:SIW302
|
3.4
|
24.8
|
0.1
|
O20E
|
A:SIW302
|
3.4
|
26.2
|
0.0
|
O23E
|
A:SIW302
|
3.4
|
26.6
|
0.0
|
O20
|
A:SIW302
|
3.4
|
24.9
|
0.1
|
O2E
|
A:SIW302
|
3.4
|
21.6
|
0.1
|
O9E
|
A:SIW302
|
3.4
|
25.5
|
0.1
|
O17
|
A:SIW302
|
3.5
|
23.5
|
0.1
|
O17E
|
A:SIW302
|
3.5
|
25.3
|
0.0
|
W4E
|
A:SIW302
|
3.5
|
21.1
|
0.1
|
W1
|
A:SIW302
|
3.5
|
11.2
|
0.1
|
W1
|
A:SIW302
|
3.5
|
43.8
|
0.1
|
W7
|
A:SIW302
|
3.5
|
35.5
|
0.1
|
W6
|
A:SIW302
|
3.5
|
19.7
|
0.1
|
W4
|
A:SIW302
|
3.5
|
43.5
|
0.1
|
W4E
|
A:SIW302
|
3.5
|
26.2
|
0.1
|
W1E
|
A:SIW302
|
3.5
|
40.9
|
0.1
|
O18E
|
A:SIW302
|
3.5
|
25.6
|
0.1
|
O9
|
A:SIW302
|
3.5
|
23.2
|
0.1
|
W2
|
A:SIW302
|
3.5
|
41.9
|
0.1
|
W3
|
A:SIW302
|
3.5
|
20.1
|
0.1
|
O1E
|
A:SIW302
|
3.5
|
25.2
|
0.1
|
O18
|
A:SIW302
|
3.5
|
24.1
|
0.1
|
W5E
|
A:SIW302
|
3.5
|
44.2
|
0.1
|
W3E
|
A:SIW302
|
3.5
|
39.2
|
0.1
|
W2E
|
A:SIW302
|
3.6
|
19.8
|
0.1
|
W5
|
A:SIW302
|
3.6
|
26.0
|
0.1
|
O18
|
A:SIW302
|
3.6
|
23.7
|
0.1
|
O9
|
A:SIW302
|
3.6
|
26.4
|
0.1
|
W2E
|
A:SIW302
|
3.6
|
27.7
|
0.1
|
W3
|
A:SIW302
|
3.6
|
17.8
|
0.1
|
W2
|
A:SIW302
|
3.6
|
28.0
|
0.0
|
O9E
|
A:SIW302
|
3.6
|
26.9
|
0.1
|
O23E
|
A:SIW302
|
3.6
|
31.3
|
0.1
|
O15E
|
A:SIW302
|
3.6
|
23.4
|
0.1
|
O23
|
A:SIW302
|
3.6
|
26.6
|
0.1
|
W1E
|
A:SIW302
|
3.6
|
10.9
|
0.1
|
W5
|
A:SIW302
|
3.6
|
18.5
|
0.1
|
O16
|
A:SIW302
|
3.6
|
25.4
|
0.1
|
W4
|
A:SIW302
|
3.6
|
11.1
|
0.1
|
O16E
|
A:SIW302
|
3.6
|
26.0
|
0.1
|
O17
|
A:SIW302
|
3.6
|
25.0
|
0.1
|
O20
|
A:SIW302
|
3.6
|
28.4
|
0.1
|
W1
|
A:SIW302
|
3.7
|
36.7
|
0.0
|
O2
|
A:SIW302
|
3.7
|
24.8
|
0.1
|
O2E
|
A:SIW302
|
3.7
|
26.3
|
0.1
|
O17E
|
A:SIW302
|
3.7
|
23.8
|
0.1
|
O20E
|
A:SIW302
|
3.7
|
24.5
|
0.1
|
O8
|
A:SIW302
|
3.7
|
27.1
|
0.1
|
O11
|
A:SIW302
|
3.7
|
25.2
|
0.0
|
O8E
|
A:SIW302
|
3.7
|
24.3
|
0.1
|
O20E
|
A:SIW302
|
3.7
|
26.5
|
0.1
|
O23E
|
A:SIW302
|
3.7
|
24.6
|
0.1
|
O1
|
A:SIW302
|
3.7
|
24.6
|
0.1
|
O23
|
A:SIW302
|
3.7
|
23.0
|
0.1
|
O1E
|
A:SIW302
|
3.7
|
24.7
|
0.1
|
W2
|
A:SIW302
|
3.7
|
10.8
|
0.1
|
O20
|
A:SIW302
|
3.7
|
26.9
|
0.0
|
O8E
|
A:SIW302
|
3.8
|
25.8
|
0.1
|
O13
|
A:SIW302
|
3.8
|
33.6
|
0.1
|
O16E
|
A:SIW302
|
3.8
|
25.5
|
0.1
|
O18E
|
A:SIW302
|
3.8
|
23.6
|
0.1
|
W7
|
A:SIW302
|
3.8
|
23.9
|
0.1
|
W2
|
A:SIW302
|
3.8
|
10.3
|
0.1
|
W1E
|
A:SIW302
|
3.8
|
11.4
|
0.1
|
O8
|
A:SIW302
|
3.8
|
21.3
|
0.1
|
O7
|
A:SIW302
|
3.8
|
27.1
|
0.1
|
W4
|
A:SIW302
|
3.8
|
32.8
|
0.0
|
O9E
|
A:SIW302
|
3.9
|
31.9
|
0.1
|
O7E
|
A:SIW302
|
3.9
|
25.3
|
0.1
|
O18E
|
A:SIW302
|
3.9
|
30.1
|
0.1
|
O8
|
A:SIW302
|
3.9
|
26.1
|
0.0
|
W4
|
A:SIW302
|
3.9
|
10.8
|
0.1
|
O2
|
A:SIW302
|
3.9
|
24.3
|
0.1
|
O1
|
A:SIW302
|
3.9
|
23.4
|
0.1
|
O3
|
A:SIW302
|
3.9
|
29.4
|
0.1
|
O11
|
A:SIW302
|
3.9
|
34.2
|
0.1
|
O3
|
A:SIW302
|
3.9
|
25.6
|
0.0
|
O15
|
A:SIW302
|
3.9
|
23.7
|
0.1
|
O15E
|
A:SIW302
|
3.9
|
25.1
|
0.1
|
O16
|
A:SIW302
|
4.0
|
22.6
|
0.1
|
O3E
|
A:SIW302
|
4.0
|
29.3
|
0.1
|
O15
|
A:SIW302
|
4.0
|
28.9
|
0.1
|
O3
|
A:SIW302
|
4.0
|
27.7
|
0.1
|
W1
|
A:SIW302
|
4.0
|
11.2
|
0.1
|
O3E
|
A:SIW302
|
4.0
|
24.2
|
0.1
|
O7E
|
A:SIW302
|
4.0
|
27.8
|
0.1
|
W5E
|
A:SIW302
|
4.0
|
33.0
|
0.0
|
O13
|
A:SIW302
|
4.1
|
26.1
|
0.0
|
O20
|
A:SIW302
|
4.1
|
31.6
|
0.1
|
W3E
|
A:SIW302
|
4.1
|
12.0
|
0.1
|
O5
|
A:SIW302
|
4.1
|
33.9
|
0.1
|
O5
|
A:SIW302
|
4.1
|
26.2
|
0.0
|
O7
|
A:SIW302
|
4.2
|
22.1
|
0.1
|
O9E
|
A:SIW302
|
4.2
|
27.2
|
0.0
|
O8
|
A:SIW302
|
4.2
|
28.3
|
0.1
|
O18E
|
A:SIW302
|
4.2
|
26.4
|
0.0
|
W1E
|
A:SIW302
|
4.2
|
34.7
|
0.0
|
W5E
|
A:SIW302
|
4.2
|
11.5
|
0.1
|
W3E
|
A:SIW302
|
4.3
|
36.9
|
0.0
|
O3
|
A:SIW302
|
4.4
|
20.6
|
0.1
|
O18
|
A:SIW302
|
4.5
|
24.8
|
0.0
|
O16
|
A:SIW302
|
4.5
|
31.6
|
0.1
|
O7
|
A:SIW302
|
4.6
|
24.8
|
0.0
|
O16
|
A:SIW302
|
4.7
|
25.1
|
0.0
|
O15E
|
A:SIW302
|
4.7
|
30.0
|
0.1
|
O15E
|
A:SIW302
|
4.7
|
26.1
|
0.0
|
O8E
|
A:SIW302
|
4.7
|
33.1
|
0.1
|
O7
|
A:SIW302
|
4.7
|
31.4
|
0.1
|
O18
|
A:SIW302
|
4.8
|
31.9
|
0.1
|
O2E
|
A:SIW302
|
4.8
|
25.6
|
0.0
|
O5
|
A:SIW302
|
4.9
|
30.1
|
0.1
|
O13E
|
A:SIW302
|
4.9
|
19.4
|
0.1
|
W7
|
A:SIW302
|
4.9
|
12.7
|
0.0
|
W7
|
A:SIW302
|
4.9
|
28.9
|
0.1
|
O1E
|
A:SIW302
|
4.9
|
33.4
|
0.1
|
O11E
|
A:SIW302
|
4.9
|
23.9
|
0.1
|
O2E
|
A:SIW302
|
4.9
|
31.5
|
0.1
|
W4E
|
A:SIW302
|
5.0
|
11.9
|
0.0
|
O8E
|
A:SIW302
|
5.0
|
26.1
|
0.0
|
|
Reference:
H.Noguchi,
L.Vandebroek,
K.Kamata,
J.R.H.Tame,
L.Van Meervelt,
T.N.Parac-Vogt,
A.R.D.Voet.
Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta) To Be Published.
Page generated: Thu Oct 10 13:23:11 2024
|