Atomistry » Silicon » PDB 1fuq-6y7o » 6qsg
Atomistry »
  Silicon »
    PDB 1fuq-6y7o »
      6qsg »

Silicon in PDB 6qsg: Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta)

Protein crystallography data

The structure of Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta), PDB code: 6qsg was solved by H.Noguchi, L.Vandebroek, K.Kamata, J.R.H.Tame, L.Van Meervelt, T.N.Parac-Vogt, A.R.D.Voet, with X-Ray Crystallography technique. A brief refinement statistics is given in the table below:

Resolution Low / High (Å) 29.97 / 1.15
Space group C 1 2 1
Cell size a, b, c (Å), α, β, γ (°) 77.367, 44.668, 65.254, 90.00, 113.28, 90.00
R / Rfree (%) 16.8 / 18.6

Other elements in 6qsg:

The structure of Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta) also contains other interesting chemical elements:

Tungsten (W) 72 atoms

Silicon Binding Sites:

The binding sites of Silicon atom in the Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta) (pdb code 6qsg). This binding sites where shown within 5.0 Angstroms radius around Silicon atom.
In total 6 binding sites of Silicon where determined in the Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta), PDB code: 6qsg:
Jump to Silicon binding site number: 1; 2; 3; 4; 5; 6;

Silicon binding site 1 out of 6 in 6qsg

Go back to Silicon Binding Sites List in 6qsg
Silicon binding site 1 out of 6 in the Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta)


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Silicon with other atoms in the Si binding site number 1 of Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta) within 5.0Å range:
probe atom residue distance (Å) B Occ
A:Si301

b:6.4
occ:0.25
SI1 A:SIW301 0.0 6.4 0.2
SI1 A:SIW301 0.0 14.1 0.2
O19E A:SIW301 1.5 27.6 0.2
O19E A:SIW301 1.5 27.9 0.2
O4 A:SIW301 1.5 21.2 0.2
O4 A:SIW301 1.5 27.1 0.2
O21 A:SIW301 1.7 23.2 0.2
O21 A:SIW301 1.7 25.6 0.2
O22 A:SIW301 1.7 11.1 0.2
O22 A:SIW301 1.7 14.2 0.2
W3E A:SIW301 3.5 17.9 0.2
O18 A:SIW301 3.5 29.7 0.2
W5E A:SIW301 3.5 17.7 0.2
W4 A:SIW301 3.5 18.3 0.2
W2 A:SIW301 3.5 18.5 0.2
W2E A:SIW301 3.5 11.3 0.2
W2 A:SIW301 3.5 17.7 0.2
W3E A:SIW301 3.5 16.1 0.2
W7 A:SIW301 3.5 10.4 0.2
O18 A:SIW301 3.5 26.0 0.2
W4E A:SIW301 3.5 11.1 0.2
W4E A:SIW301 3.5 10.7 0.2
W7 A:SIW301 3.5 11.5 0.2
W5 A:SIW301 3.5 11.4 0.2
W2E A:SIW301 3.5 10.4 0.2
W6 A:SIW301 3.5 12.3 0.2
W5 A:SIW301 3.5 11.6 0.2
W6 A:SIW301 3.5 11.7 0.2
W3 A:SIW301 3.5 11.6 0.2
W3 A:SIW301 3.5 11.5 0.2
W5E A:SIW301 3.5 7.4 0.2
W1 A:SIW301 3.5 7.0 0.2
W4 A:SIW301 3.5 6.7 0.2
W1E A:SIW301 3.6 6.7 0.2
W1E A:SIW301 3.6 6.9 0.2
W1 A:SIW301 3.6 6.8 0.2
O18E A:SIW301 3.6 13.4 0.2
O18E A:SIW301 3.6 15.6 0.2
O9E A:SIW301 3.6 16.1 0.2
O9E A:SIW301 3.6 16.8 0.2
O2E A:SIW301 3.6 15.1 0.2
O17 A:SIW301 3.6 5.2 0.2
O16 A:SIW301 3.6 23.3 0.2
O9 A:SIW301 3.6 23.8 0.2
O17 A:SIW301 3.6 6.6 0.2
O9 A:SIW301 3.6 17.9 0.2
O16E A:SIW301 3.6 7.4 0.2
O23 A:SIW301 3.6 4.6 0.2
O16 A:SIW301 3.6 25.8 0.2
O16E A:SIW301 3.6 4.7 0.2
O2 A:SIW301 3.6 16.5 0.2
O17E A:SIW301 3.7 21.1 0.2
O8 A:SIW301 3.7 11.3 0.2
O23 A:SIW301 3.7 5.5 0.2
O8E A:SIW301 3.7 16.8 0.2
O2 A:SIW301 3.7 15.3 0.2
O2E A:SIW301 3.7 10.5 0.2
O17E A:SIW301 3.7 24.8 0.2
O8 A:SIW301 3.7 12.2 0.2
O8E A:SIW301 3.7 13.6 0.2
O1E A:SIW301 3.7 22.5 0.2
O20 A:SIW301 3.7 15.7 0.2
O20E A:SIW301 3.7 16.2 0.2
O20 A:SIW301 3.7 13.7 0.2
O20E A:SIW301 3.7 10.1 0.2
O23E A:SIW301 3.7 17.1 0.2
O1 A:SIW301 3.7 19.5 0.2
O1E A:SIW301 3.7 21.0 0.2
O1 A:SIW301 3.7 14.7 0.2
O23E A:SIW301 3.8 15.8 0.2
O7E A:SIW301 3.8 4.2 0.2
O7E A:SIW301 3.8 6.5 0.2
O15 A:SIW301 3.8 21.4 0.2
O7 A:SIW301 3.8 11.2 0.2
O7 A:SIW301 3.8 16.5 0.2
O15 A:SIW301 3.9 16.3 0.2
O15E A:SIW301 3.9 15.1 0.2
O15E A:SIW301 3.9 11.5 0.2
O3E A:SIW301 4.0 9.0 0.2
O3E A:SIW301 4.0 7.7 0.2
O3 A:SIW301 4.0 18.3 0.2
O3 A:SIW301 4.0 12.0 0.2

Silicon binding site 2 out of 6 in 6qsg

Go back to Silicon Binding Sites List in 6qsg
Silicon binding site 2 out of 6 in the Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta)


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Silicon with other atoms in the Si binding site number 2 of Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta) within 5.0Å range:
probe atom residue distance (Å) B Occ
A:Si301

b:14.1
occ:0.25
SI1 A:SIW301 0.0 14.1 0.2
SI1 A:SIW301 0.0 6.4 0.2
O19E A:SIW301 1.5 27.6 0.2
O19E A:SIW301 1.5 27.9 0.2
O4 A:SIW301 1.5 21.2 0.2
O4 A:SIW301 1.5 27.1 0.2
O22 A:SIW301 1.7 11.1 0.2
O22 A:SIW301 1.7 14.2 0.2
O21 A:SIW301 1.7 23.2 0.2
O21 A:SIW301 1.7 25.6 0.2
W3E A:SIW301 3.5 17.9 0.2
W4 A:SIW301 3.5 18.3 0.2
W3E A:SIW301 3.5 16.1 0.2
W5 A:SIW301 3.5 11.4 0.2
W6 A:SIW301 3.5 12.3 0.2
W2E A:SIW301 3.5 11.3 0.2
W5E A:SIW301 3.5 17.7 0.2
O18 A:SIW301 3.5 29.7 0.2
W5 A:SIW301 3.5 11.6 0.2
W2 A:SIW301 3.5 18.5 0.2
W6 A:SIW301 3.5 11.7 0.2
W7 A:SIW301 3.5 10.4 0.2
W2E A:SIW301 3.5 10.4 0.2
W2 A:SIW301 3.5 17.7 0.2
W4E A:SIW301 3.5 11.1 0.2
W3 A:SIW301 3.5 11.5 0.2
W3 A:SIW301 3.5 11.6 0.2
W5E A:SIW301 3.5 7.4 0.2
W1E A:SIW301 3.5 6.9 0.2
O18 A:SIW301 3.5 26.0 0.2
W1E A:SIW301 3.5 6.7 0.2
W7 A:SIW301 3.5 11.5 0.2
W4E A:SIW301 3.5 10.7 0.2
W4 A:SIW301 3.6 6.7 0.2
W1 A:SIW301 3.6 7.0 0.2
O18E A:SIW301 3.6 15.6 0.2
O18E A:SIW301 3.6 13.4 0.2
O9E A:SIW301 3.6 16.1 0.2
W1 A:SIW301 3.6 6.8 0.2
O9E A:SIW301 3.6 16.8 0.2
O17 A:SIW301 3.6 5.2 0.2
O23 A:SIW301 3.6 4.6 0.2
O2E A:SIW301 3.6 15.1 0.2
O17 A:SIW301 3.6 6.6 0.2
O9 A:SIW301 3.6 23.8 0.2
O2 A:SIW301 3.6 16.5 0.2
O16 A:SIW301 3.6 23.3 0.2
O17E A:SIW301 3.6 21.1 0.2
O9 A:SIW301 3.6 17.9 0.2
O16 A:SIW301 3.6 25.8 0.2
O23 A:SIW301 3.6 5.5 0.2
O16E A:SIW301 3.6 7.4 0.2
O8E A:SIW301 3.7 16.8 0.2
O16E A:SIW301 3.7 4.7 0.2
O2 A:SIW301 3.7 15.3 0.2
O17E A:SIW301 3.7 24.8 0.2
O8 A:SIW301 3.7 11.3 0.2
O20E A:SIW301 3.7 10.1 0.2
O8E A:SIW301 3.7 13.6 0.2
O20E A:SIW301 3.7 16.2 0.2
O2E A:SIW301 3.7 10.5 0.2
O1E A:SIW301 3.7 22.5 0.2
O8 A:SIW301 3.7 12.2 0.2
O20 A:SIW301 3.7 13.7 0.2
O20 A:SIW301 3.7 15.7 0.2
O23E A:SIW301 3.7 17.1 0.2
O1E A:SIW301 3.7 21.0 0.2
O1 A:SIW301 3.7 19.5 0.2
O1 A:SIW301 3.7 14.7 0.2
O23E A:SIW301 3.8 15.8 0.2
O7E A:SIW301 3.8 4.2 0.2
O7E A:SIW301 3.8 6.5 0.2
O15 A:SIW301 3.8 21.4 0.2
O7 A:SIW301 3.9 11.2 0.2
O15 A:SIW301 3.9 16.3 0.2
O7 A:SIW301 3.9 16.5 0.2
O15E A:SIW301 3.9 15.1 0.2
O15E A:SIW301 3.9 11.5 0.2
O3E A:SIW301 4.0 9.0 0.2
O3E A:SIW301 4.0 7.7 0.2
O3 A:SIW301 4.0 18.3 0.2
O3 A:SIW301 4.0 12.0 0.2

Silicon binding site 3 out of 6 in 6qsg

Go back to Silicon Binding Sites List in 6qsg
Silicon binding site 3 out of 6 in the Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta)


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Silicon with other atoms in the Si binding site number 3 of Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta) within 5.0Å range:
probe atom residue distance (Å) B Occ
A:Si302

b:31.2
occ:0.06
SI1 A:SIW302 0.0 31.2 0.1
SI1 A:SIW302 0.1 24.7 0.0
O22 A:SIW302 0.2 24.5 0.1
O22 A:SIW302 0.3 22.8 0.1
O4 A:SIW302 1.4 25.4 0.0
O19E A:SIW302 1.5 32.1 0.1
O4 A:SIW302 1.5 31.0 0.1
O19E A:SIW302 1.6 26.2 0.0
O21 A:SIW302 1.6 25.0 0.0
O22 A:SIW302 1.7 30.3 0.1
O22 A:SIW302 1.7 24.2 0.0
O21 A:SIW302 1.7 29.3 0.1
SI1 A:SIW302 1.7 23.9 0.1
SI1 A:SIW302 1.8 24.9 0.1
W5 A:SIW302 2.1 26.0 0.1
O17 A:SIW302 2.1 23.5 0.1
O23 A:SIW302 2.2 23.0 0.1
O23 A:SIW302 2.3 26.6 0.1
W6 A:SIW302 2.3 18.6 0.1
W3 A:SIW302 2.3 17.8 0.1
W5 A:SIW302 2.4 18.5 0.1
O19E A:SIW302 2.4 23.4 0.1
O17 A:SIW302 2.4 25.0 0.1
O15 A:SIW302 2.5 28.9 0.1
O15 A:SIW302 2.5 23.7 0.1
W6 A:SIW302 2.5 19.7 0.1
O4 A:SIW302 2.6 23.0 0.1
W3 A:SIW302 2.6 20.1 0.1
O19E A:SIW302 2.6 27.4 0.1
O21 A:SIW302 2.6 26.9 0.1
O4 A:SIW302 2.7 27.0 0.1
O21 A:SIW302 2.8 23.5 0.1
O20E A:SIW302 2.8 24.5 0.1
O2 A:SIW302 2.9 24.8 0.1
O9 A:SIW302 3.0 23.2 0.1
O17E A:SIW302 3.1 23.0 0.1
O17E A:SIW302 3.1 23.8 0.1
O20E A:SIW302 3.1 26.5 0.1
O2 A:SIW302 3.2 24.3 0.1
O1 A:SIW302 3.2 23.4 0.1
O23E A:SIW302 3.2 24.8 0.1
O1 A:SIW302 3.3 24.6 0.1
O9 A:SIW302 3.4 26.4 0.1
W1 A:SIW302 3.4 36.7 0.0
W2 A:SIW302 3.5 28.0 0.0
O23E A:SIW302 3.5 24.6 0.1
O18 A:SIW302 3.5 24.8 0.0
O9 A:SIW302 3.5 24.4 0.0
W3 A:SIW302 3.5 13.5 0.0
W7 A:SIW302 3.5 12.7 0.0
W4E A:SIW302 3.5 11.9 0.0
W1 A:SIW302 3.5 11.2 0.1
W3E A:SIW302 3.5 12.0 0.1
W4 A:SIW302 3.5 11.1 0.1
W6 A:SIW302 3.5 20.4 0.1
W2 A:SIW302 3.5 10.8 0.1
W5E A:SIW302 3.5 11.5 0.1
W5E A:SIW302 3.5 33.0 0.0
W7 A:SIW302 3.5 28.9 0.1
W1E A:SIW302 3.5 11.4 0.1
W4 A:SIW302 3.5 32.8 0.0
W5 A:SIW302 3.5 21.7 0.1
O18E A:SIW302 3.5 30.1 0.1
W4E A:SIW302 3.5 35.0 0.1
W2E A:SIW302 3.5 31.6 0.1
O18 A:SIW302 3.5 31.9 0.1
W3 A:SIW302 3.6 19.8 0.1
O8 A:SIW302 3.6 26.1 0.0
W5 A:SIW302 3.6 11.5 0.0
W6 A:SIW302 3.6 12.9 0.0
O9 A:SIW302 3.6 31.0 0.1
O9E A:SIW302 3.6 31.9 0.1
O9E A:SIW302 3.6 26.9 0.1
W2E A:SIW302 3.6 11.8 0.0
O16E A:SIW302 3.6 25.6 0.0
O20 A:SIW302 3.6 26.9 0.0
O18E A:SIW302 3.6 26.4 0.0
W1E A:SIW302 3.6 40.9 0.1
W1E A:SIW302 3.6 34.7 0.0
O16 A:SIW302 3.6 31.6 0.1
W3E A:SIW302 3.6 36.9 0.0
O16 A:SIW302 3.6 25.1 0.0
O17 A:SIW302 3.6 25.6 0.0
O17E A:SIW302 3.6 31.6 0.1
O16E A:SIW302 3.6 33.4 0.1
O20E A:SIW302 3.6 32.4 0.1
O2E A:SIW302 3.6 25.6 0.0
O2E A:SIW302 3.7 31.5 0.1
O20 A:SIW302 3.7 31.6 0.1
O17 A:SIW302 3.7 31.5 0.1
O2 A:SIW302 3.7 30.8 0.1
O1 A:SIW302 3.7 25.2 0.0
O8 A:SIW302 3.7 28.3 0.1
O2 A:SIW302 3.7 26.0 0.0
O9E A:SIW302 3.7 27.2 0.0
O8E A:SIW302 3.7 33.1 0.1
W4 A:SIW302 3.7 43.5 0.1
O23E A:SIW302 3.7 31.3 0.1
O23 A:SIW302 3.7 31.9 0.1
O1E A:SIW302 3.7 33.4 0.1
O17E A:SIW302 3.7 25.3 0.0
O23E A:SIW302 3.7 26.6 0.0
O20E A:SIW302 3.7 26.2 0.0
O13 A:SIW302 3.7 24.0 0.1
O1 A:SIW302 3.7 30.1 0.1
O23 A:SIW302 3.7 26.8 0.0
O8E A:SIW302 3.8 26.1 0.0
O18E A:SIW302 3.8 25.6 0.1
O7 A:SIW302 3.8 24.8 0.0
O5 A:SIW302 3.8 30.1 0.1
O1E A:SIW302 3.8 25.3 0.0
O20 A:SIW302 3.8 24.9 0.1
O9E A:SIW302 3.8 25.5 0.1
O7 A:SIW302 3.9 31.4 0.1
O7E A:SIW302 3.9 25.4 0.0
O7E A:SIW302 3.9 33.4 0.1
W3E A:SIW302 3.9 39.2 0.1
O11 A:SIW302 3.9 29.5 0.1
O15E A:SIW302 3.9 30.0 0.1
O13 A:SIW302 3.9 30.5 0.1
O15 A:SIW302 3.9 26.2 0.0
W5E A:SIW302 3.9 11.5 0.1
O15 A:SIW302 3.9 33.3 0.1
W1 A:SIW302 3.9 11.2 0.1
W3E A:SIW302 3.9 11.5 0.1
O5 A:SIW302 4.0 22.9 0.1
W2 A:SIW302 4.0 10.3 0.1
O3 A:SIW302 4.0 25.6 0.0
W1E A:SIW302 4.0 10.9 0.1
O15E A:SIW302 4.0 26.1 0.0
W4 A:SIW302 4.0 10.8 0.1
W2 A:SIW302 4.0 41.9 0.1
O3 A:SIW302 4.0 29.4 0.1
O3E A:SIW302 4.0 33.4 0.1
O3E A:SIW302 4.0 26.1 0.0
O11 A:SIW302 4.1 23.1 0.1
O20 A:SIW302 4.1 28.4 0.1
O3 A:SIW302 4.1 27.7 0.1
W5E A:SIW302 4.2 44.2 0.1
O18E A:SIW302 4.2 23.6 0.1
W1 A:SIW302 4.2 43.8 0.1
O3 A:SIW302 4.3 20.6 0.1
O8 A:SIW302 4.3 21.3 0.1
O15E A:SIW302 4.4 23.4 0.1
O8 A:SIW302 4.4 27.1 0.1
O15E A:SIW302 4.5 25.1 0.1
O8E A:SIW302 4.6 24.3 0.1
O16 A:SIW302 4.6 25.4 0.1
O18 A:SIW302 4.7 23.7 0.1
O1E A:SIW302 4.7 24.7 0.1
O2E A:SIW302 4.8 21.6 0.1
O16 A:SIW302 4.8 22.6 0.1
O1E A:SIW302 4.8 25.2 0.1
O8E A:SIW302 4.8 25.8 0.1
O18 A:SIW302 4.9 24.1 0.1
O2E A:SIW302 4.9 26.3 0.1
O7 A:SIW302 4.9 27.1 0.1
W2E A:SIW302 4.9 27.7 0.1
O7 A:SIW302 5.0 22.1 0.1
W7 A:SIW302 5.0 35.5 0.1

Silicon binding site 4 out of 6 in 6qsg

Go back to Silicon Binding Sites List in 6qsg
Silicon binding site 4 out of 6 in the Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta)


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Silicon with other atoms in the Si binding site number 4 of Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta) within 5.0Å range:
probe atom residue distance (Å) B Occ
A:Si302

b:24.7
occ:0.03
SI1 A:SIW302 0.0 24.7 0.0
SI1 A:SIW302 0.1 31.2 0.1
O22 A:SIW302 0.1 24.5 0.1
O22 A:SIW302 0.3 22.8 0.1
O19E A:SIW302 1.4 32.1 0.1
O4 A:SIW302 1.4 31.0 0.1
O19E A:SIW302 1.5 26.2 0.0
O4 A:SIW302 1.5 25.4 0.0
O22 A:SIW302 1.7 24.2 0.0
O22 A:SIW302 1.7 30.3 0.1
O21 A:SIW302 1.7 25.0 0.0
SI1 A:SIW302 1.7 23.9 0.1
SI1 A:SIW302 1.8 24.9 0.1
O21 A:SIW302 1.8 29.3 0.1
W5 A:SIW302 2.1 26.0 0.1
O23 A:SIW302 2.1 23.0 0.1
O17 A:SIW302 2.2 23.5 0.1
O23 A:SIW302 2.2 26.6 0.1
W5 A:SIW302 2.3 18.5 0.1
W3 A:SIW302 2.3 17.8 0.1
O19E A:SIW302 2.3 23.4 0.1
W6 A:SIW302 2.4 18.6 0.1
O15 A:SIW302 2.4 28.9 0.1
W6 A:SIW302 2.5 19.7 0.1
O15 A:SIW302 2.5 23.7 0.1
O17 A:SIW302 2.5 25.0 0.1
O19E A:SIW302 2.6 27.4 0.1
O4 A:SIW302 2.6 23.0 0.1
O21 A:SIW302 2.6 26.9 0.1
W3 A:SIW302 2.7 20.1 0.1
O20E A:SIW302 2.7 24.5 0.1
O21 A:SIW302 2.7 23.5 0.1
O4 A:SIW302 2.8 27.0 0.1
O2 A:SIW302 2.8 24.8 0.1
O2 A:SIW302 3.1 24.3 0.1
O17E A:SIW302 3.1 23.8 0.1
O20E A:SIW302 3.1 26.5 0.1
O9 A:SIW302 3.1 23.2 0.1
O1 A:SIW302 3.2 23.4 0.1
O17E A:SIW302 3.2 23.0 0.1
O23E A:SIW302 3.3 24.8 0.1
O1 A:SIW302 3.4 24.6 0.1
W3E A:SIW302 3.4 12.0 0.1
W5E A:SIW302 3.4 11.5 0.1
O9 A:SIW302 3.5 26.4 0.1
W6 A:SIW302 3.5 20.4 0.1
O9E A:SIW302 3.5 26.9 0.1
W2E A:SIW302 3.5 31.6 0.1
W4E A:SIW302 3.5 35.0 0.1
W7 A:SIW302 3.5 12.7 0.0
W2E A:SIW302 3.5 11.8 0.0
O9E A:SIW302 3.5 31.9 0.1
W1E A:SIW302 3.5 40.9 0.1
W1 A:SIW302 3.5 36.7 0.0
W1 A:SIW302 3.5 11.2 0.1
W2 A:SIW302 3.5 28.0 0.0
W5E A:SIW302 3.5 33.0 0.0
O23E A:SIW302 3.5 24.6 0.1
W4 A:SIW302 3.5 32.8 0.0
W1E A:SIW302 3.5 11.4 0.1
W1E A:SIW302 3.5 34.7 0.0
W4E A:SIW302 3.5 11.9 0.0
W5 A:SIW302 3.5 11.5 0.0
O18E A:SIW302 3.5 26.4 0.0
W6 A:SIW302 3.5 12.9 0.0
W3E A:SIW302 3.5 36.9 0.0
O18 A:SIW302 3.5 31.9 0.1
W3 A:SIW302 3.6 13.5 0.0
O18 A:SIW302 3.6 24.8 0.0
O17E A:SIW302 3.6 31.6 0.1
W5 A:SIW302 3.6 21.7 0.1
O9 A:SIW302 3.6 24.4 0.0
O9E A:SIW302 3.6 27.2 0.0
O2E A:SIW302 3.6 31.5 0.1
W3 A:SIW302 3.6 19.8 0.1
O9 A:SIW302 3.6 31.0 0.1
O18E A:SIW302 3.6 30.1 0.1
W7 A:SIW302 3.6 28.9 0.1
W4 A:SIW302 3.6 11.1 0.1
O20 A:SIW302 3.6 31.6 0.1
W2 A:SIW302 3.6 10.8 0.1
O23E A:SIW302 3.6 31.3 0.1
O16E A:SIW302 3.6 25.6 0.0
O16 A:SIW302 3.6 25.1 0.0
O17 A:SIW302 3.6 31.5 0.1
O1E A:SIW302 3.6 33.4 0.1
O20 A:SIW302 3.6 26.9 0.0
O17E A:SIW302 3.6 25.3 0.0
O20E A:SIW302 3.6 26.2 0.0
O20E A:SIW302 3.6 32.4 0.1
O2 A:SIW302 3.6 26.0 0.0
O2E A:SIW302 3.7 25.6 0.0
O8 A:SIW302 3.7 26.1 0.0
O17 A:SIW302 3.7 25.6 0.0
W4 A:SIW302 3.7 43.5 0.1
O13 A:SIW302 3.7 24.0 0.1
O16E A:SIW302 3.7 33.4 0.1
O8E A:SIW302 3.7 33.1 0.1
O8E A:SIW302 3.7 26.1 0.0
O23 A:SIW302 3.7 31.9 0.1
O16 A:SIW302 3.7 31.6 0.1
O23 A:SIW302 3.7 26.8 0.0
O8 A:SIW302 3.7 28.3 0.1
O23E A:SIW302 3.7 26.6 0.0
O18E A:SIW302 3.7 25.6 0.1
O2 A:SIW302 3.7 30.8 0.1
O1E A:SIW302 3.7 25.3 0.0
O1 A:SIW302 3.7 25.2 0.0
O1 A:SIW302 3.8 30.1 0.1
O15E A:SIW302 3.8 30.0 0.1
O9E A:SIW302 3.8 25.5 0.1
W3E A:SIW302 3.8 39.2 0.1
O7E A:SIW302 3.8 25.4 0.0
O13 A:SIW302 3.9 30.5 0.1
O7 A:SIW302 3.9 24.8 0.0
O5 A:SIW302 3.9 30.1 0.1
O11 A:SIW302 3.9 29.5 0.1
O7E A:SIW302 3.9 33.4 0.1
O20 A:SIW302 3.9 24.9 0.1
W4 A:SIW302 3.9 10.8 0.1
W2 A:SIW302 3.9 10.3 0.1
W1E A:SIW302 3.9 10.9 0.1
O15 A:SIW302 3.9 26.2 0.0
O7 A:SIW302 3.9 31.4 0.1
O15E A:SIW302 3.9 26.1 0.0
O5 A:SIW302 4.0 22.9 0.1
O3E A:SIW302 4.0 33.4 0.1
O15 A:SIW302 4.0 33.3 0.1
W1 A:SIW302 4.0 11.2 0.1
W3E A:SIW302 4.0 11.5 0.1
O3E A:SIW302 4.0 26.1 0.0
W5E A:SIW302 4.0 11.5 0.1
O3 A:SIW302 4.0 25.6 0.0
W2 A:SIW302 4.1 41.9 0.1
O18E A:SIW302 4.1 23.6 0.1
O3 A:SIW302 4.1 29.4 0.1
O3 A:SIW302 4.1 27.7 0.1
O3 A:SIW302 4.2 20.6 0.1
W5E A:SIW302 4.2 44.2 0.1
O11 A:SIW302 4.2 23.1 0.1
O20 A:SIW302 4.2 28.4 0.1
O8 A:SIW302 4.3 21.3 0.1
W1 A:SIW302 4.3 43.8 0.1
O8E A:SIW302 4.5 24.3 0.1
O15E A:SIW302 4.5 23.4 0.1
O8 A:SIW302 4.5 27.1 0.1
O15E A:SIW302 4.5 25.1 0.1
O16 A:SIW302 4.6 25.4 0.1
O1E A:SIW302 4.7 24.7 0.1
O16 A:SIW302 4.8 22.6 0.1
O18 A:SIW302 4.8 23.7 0.1
O8E A:SIW302 4.8 25.8 0.1
O2E A:SIW302 4.8 21.6 0.1
O1E A:SIW302 4.9 25.2 0.1
W2E A:SIW302 4.9 27.7 0.1
O7 A:SIW302 4.9 22.1 0.1
O18 A:SIW302 4.9 24.1 0.1
O2E A:SIW302 4.9 26.3 0.1
O7 A:SIW302 5.0 27.1 0.1
W7 A:SIW302 5.0 35.5 0.1

Silicon binding site 5 out of 6 in 6qsg

Go back to Silicon Binding Sites List in 6qsg
Silicon binding site 5 out of 6 in the Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta)


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Silicon with other atoms in the Si binding site number 5 of Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta) within 5.0Å range:
probe atom residue distance (Å) B Occ
A:Si302

b:24.9
occ:0.05
SI1 A:SIW302 0.0 24.9 0.1
O22 A:SIW302 0.2 24.2 0.0
O22 A:SIW302 0.2 30.3 0.1
SI1 A:SIW302 0.4 23.9 0.1
O19E A:SIW302 1.2 23.4 0.1
O19E A:SIW302 1.5 27.4 0.1
O4 A:SIW302 1.5 23.0 0.1
O21 A:SIW302 1.6 26.9 0.1
O22 A:SIW302 1.7 24.5 0.1
O21 A:SIW302 1.7 23.5 0.1
SI1 A:SIW302 1.8 24.7 0.0
SI1 A:SIW302 1.8 31.2 0.1
O22 A:SIW302 1.8 22.8 0.1
O4 A:SIW302 1.8 27.0 0.1
O17 A:SIW302 2.1 25.6 0.0
O17 A:SIW302 2.2 31.5 0.1
O23 A:SIW302 2.2 31.9 0.1
O23 A:SIW302 2.3 26.8 0.0
W6 A:SIW302 2.3 20.4 0.1
W3 A:SIW302 2.3 13.5 0.0
W5 A:SIW302 2.3 21.7 0.1
W6 A:SIW302 2.3 12.9 0.0
W3 A:SIW302 2.4 19.8 0.1
W5 A:SIW302 2.4 11.5 0.0
O15 A:SIW302 2.4 26.2 0.0
O15 A:SIW302 2.5 33.3 0.1
O4 A:SIW302 2.6 25.4 0.0
O4 A:SIW302 2.6 31.0 0.1
O19E A:SIW302 2.6 32.1 0.1
O19E A:SIW302 2.6 26.2 0.0
O21 A:SIW302 2.7 25.0 0.0
O21 A:SIW302 2.8 29.3 0.1
O9 A:SIW302 3.0 24.4 0.0
O9 A:SIW302 3.1 31.0 0.1
O17E A:SIW302 3.1 31.6 0.1
O20E A:SIW302 3.1 32.4 0.1
O2 A:SIW302 3.1 26.0 0.0
O17E A:SIW302 3.1 25.3 0.0
O2 A:SIW302 3.1 30.8 0.1
O1 A:SIW302 3.2 25.2 0.0
O20E A:SIW302 3.2 26.2 0.0
O18E A:SIW302 3.2 25.6 0.1
W1E A:SIW302 3.2 40.9 0.1
O23E A:SIW302 3.2 31.3 0.1
O1 A:SIW302 3.2 30.1 0.1
O23E A:SIW302 3.3 26.6 0.0
W4 A:SIW302 3.3 43.5 0.1
O8E A:SIW302 3.4 24.3 0.1
W2E A:SIW302 3.4 27.7 0.1
O16 A:SIW302 3.4 25.4 0.1
O9E A:SIW302 3.4 26.9 0.1
W7 A:SIW302 3.4 35.5 0.1
O20E A:SIW302 3.4 24.5 0.1
W5 A:SIW302 3.4 26.0 0.1
O2 A:SIW302 3.5 24.8 0.1
W3E A:SIW302 3.5 39.2 0.1
W7 A:SIW302 3.5 23.9 0.1
W2 A:SIW302 3.5 10.3 0.1
W2E A:SIW302 3.5 19.8 0.1
W1 A:SIW302 3.5 11.2 0.1
W5 A:SIW302 3.5 18.5 0.1
W4 A:SIW302 3.5 10.8 0.1
W1E A:SIW302 3.5 10.9 0.1
W4E A:SIW302 3.5 21.1 0.1
W3 A:SIW302 3.5 17.8 0.1
W6 A:SIW302 3.5 18.6 0.1
W5E A:SIW302 3.5 11.5 0.1
O18E A:SIW302 3.5 23.6 0.1
W3E A:SIW302 3.5 11.5 0.1
O18 A:SIW302 3.6 23.7 0.1
O9 A:SIW302 3.6 23.2 0.1
O9E A:SIW302 3.6 25.5 0.1
W2 A:SIW302 3.6 41.9 0.1
O16 A:SIW302 3.6 22.6 0.1
O1E A:SIW302 3.6 24.7 0.1
O16E A:SIW302 3.6 25.5 0.1
O7E A:SIW302 3.6 25.3 0.1
O20 A:SIW302 3.6 24.9 0.1
O2E A:SIW302 3.7 21.6 0.1
O20E A:SIW302 3.7 26.5 0.1
O16E A:SIW302 3.7 26.0 0.1
O17 A:SIW302 3.7 23.5 0.1
O2 A:SIW302 3.7 24.3 0.1
O8 A:SIW302 3.7 21.3 0.1
W4E A:SIW302 3.7 26.2 0.1
O17E A:SIW302 3.7 23.0 0.1
O8E A:SIW302 3.7 25.8 0.1
W6 A:SIW302 3.7 19.7 0.1
O17E A:SIW302 3.7 23.8 0.1
O23 A:SIW302 3.7 26.6 0.1
O1E A:SIW302 3.7 25.2 0.1
O1 A:SIW302 3.7 23.4 0.1
O23E A:SIW302 3.7 24.8 0.1
O23 A:SIW302 3.7 23.0 0.1
W3 A:SIW302 3.8 20.1 0.1
O5 A:SIW302 3.8 33.9 0.1
O18 A:SIW302 3.8 24.1 0.1
O9E A:SIW302 3.8 31.9 0.1
O20 A:SIW302 3.8 26.9 0.0
W5E A:SIW302 3.8 44.2 0.1
O20 A:SIW302 3.8 31.6 0.1
O5 A:SIW302 3.8 26.2 0.0
O7 A:SIW302 3.8 22.1 0.1
O7 A:SIW302 3.8 27.1 0.1
O11 A:SIW302 3.9 25.2 0.0
O7E A:SIW302 3.9 27.8 0.1
W1 A:SIW302 3.9 43.8 0.1
O2E A:SIW302 3.9 26.3 0.1
O1 A:SIW302 3.9 24.6 0.1
O17 A:SIW302 3.9 25.0 0.1
O9E A:SIW302 3.9 27.2 0.0
O9 A:SIW302 3.9 26.4 0.1
W1 A:SIW302 3.9 36.7 0.0
O8 A:SIW302 3.9 27.1 0.1
O13 A:SIW302 3.9 33.6 0.1
O11 A:SIW302 3.9 34.2 0.1
W3E A:SIW302 3.9 12.0 0.1
W2 A:SIW302 3.9 28.0 0.0
O15 A:SIW302 3.9 28.9 0.1
O13 A:SIW302 3.9 26.1 0.0
W5E A:SIW302 3.9 11.5 0.1
O3 A:SIW302 3.9 27.7 0.1
O15E A:SIW302 3.9 23.4 0.1
W1 A:SIW302 3.9 11.2 0.1
W5E A:SIW302 3.9 33.0 0.0
W1E A:SIW302 4.0 11.4 0.1
O23E A:SIW302 4.0 24.6 0.1
W4 A:SIW302 4.0 32.8 0.0
W4 A:SIW302 4.0 11.1 0.1
W2 A:SIW302 4.0 10.8 0.1
O15 A:SIW302 4.0 23.7 0.1
O3E A:SIW302 4.0 24.2 0.1
O3 A:SIW302 4.0 20.6 0.1
W3E A:SIW302 4.0 36.9 0.0
O20 A:SIW302 4.0 28.4 0.1
W1E A:SIW302 4.0 34.7 0.0
O3E A:SIW302 4.0 29.3 0.1
O15E A:SIW302 4.1 25.1 0.1
O18E A:SIW302 4.1 30.1 0.1
O18E A:SIW302 4.2 26.4 0.0
O8 A:SIW302 4.2 26.1 0.0
O3 A:SIW302 4.2 25.6 0.0
O3 A:SIW302 4.3 29.4 0.1
O8 A:SIW302 4.3 28.3 0.1
O15E A:SIW302 4.4 30.0 0.1
O15E A:SIW302 4.5 26.1 0.0
O18 A:SIW302 4.7 24.8 0.0
O18 A:SIW302 4.7 31.9 0.1
O2E A:SIW302 4.8 31.5 0.1
O2E A:SIW302 4.8 25.6 0.0
O16 A:SIW302 4.8 25.1 0.0
O12E A:SIW302 4.8 23.7 0.1
O16 A:SIW302 4.8 31.6 0.1
O1E A:SIW302 4.8 33.4 0.1
O8E A:SIW302 4.8 33.1 0.1
O8E A:SIW302 4.9 26.1 0.0
O1E A:SIW302 4.9 25.3 0.0
O14 A:SIW302 4.9 25.5 0.1
O7 A:SIW302 4.9 24.8 0.0
O7 A:SIW302 5.0 31.4 0.1

Silicon binding site 6 out of 6 in 6qsg

Go back to Silicon Binding Sites List in 6qsg
Silicon binding site 6 out of 6 in the Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta)


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Silicon with other atoms in the Si binding site number 6 of Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta) within 5.0Å range:
probe atom residue distance (Å) B Occ
A:Si302

b:23.9
occ:0.05
SI1 A:SIW302 0.0 23.9 0.1
O22 A:SIW302 0.2 30.3 0.1
SI1 A:SIW302 0.4 24.9 0.1
O22 A:SIW302 0.4 24.2 0.0
O4 A:SIW302 1.4 23.0 0.1
O19E A:SIW302 1.4 27.4 0.1
O19E A:SIW302 1.5 23.4 0.1
O4 A:SIW302 1.5 27.0 0.1
O22 A:SIW302 1.7 24.5 0.1
O22 A:SIW302 1.7 22.8 0.1
O21 A:SIW302 1.7 26.9 0.1
SI1 A:SIW302 1.7 31.2 0.1
SI1 A:SIW302 1.7 24.7 0.0
O21 A:SIW302 2.1 23.5 0.1
W3 A:SIW302 2.1 13.5 0.0
W5 A:SIW302 2.2 21.7 0.1
O17 A:SIW302 2.2 25.6 0.0
O15 A:SIW302 2.3 33.3 0.1
O23 A:SIW302 2.3 31.9 0.1
O15 A:SIW302 2.4 26.2 0.0
W3 A:SIW302 2.4 19.8 0.1
O17 A:SIW302 2.4 31.5 0.1
O4 A:SIW302 2.5 25.4 0.0
O21 A:SIW302 2.5 29.3 0.1
W5 A:SIW302 2.5 11.5 0.0
O21 A:SIW302 2.5 25.0 0.0
O19E A:SIW302 2.5 32.1 0.1
O23 A:SIW302 2.6 26.8 0.0
W6 A:SIW302 2.6 20.4 0.1
W6 A:SIW302 2.6 12.9 0.0
O4 A:SIW302 2.7 31.0 0.1
O19E A:SIW302 2.7 26.2 0.0
O9 A:SIW302 2.8 24.4 0.0
O1 A:SIW302 2.8 25.2 0.0
O2 A:SIW302 2.8 30.8 0.1
O20E A:SIW302 3.0 32.4 0.1
O1 A:SIW302 3.0 30.1 0.1
O2 A:SIW302 3.1 26.0 0.0
O9 A:SIW302 3.2 31.0 0.1
W5E A:SIW302 3.2 11.5 0.1
W3E A:SIW302 3.3 11.5 0.1
W6 A:SIW302 3.3 18.6 0.1
O17E A:SIW302 3.3 31.6 0.1
O17E A:SIW302 3.4 23.0 0.1
O23E A:SIW302 3.4 24.8 0.1
O20E A:SIW302 3.4 26.2 0.0
O23E A:SIW302 3.4 26.6 0.0
O20 A:SIW302 3.4 24.9 0.1
O2E A:SIW302 3.4 21.6 0.1
O9E A:SIW302 3.4 25.5 0.1
O17 A:SIW302 3.5 23.5 0.1
O17E A:SIW302 3.5 25.3 0.0
W4E A:SIW302 3.5 21.1 0.1
W1 A:SIW302 3.5 11.2 0.1
W1 A:SIW302 3.5 43.8 0.1
W7 A:SIW302 3.5 35.5 0.1
W6 A:SIW302 3.5 19.7 0.1
W4 A:SIW302 3.5 43.5 0.1
W4E A:SIW302 3.5 26.2 0.1
W1E A:SIW302 3.5 40.9 0.1
O18E A:SIW302 3.5 25.6 0.1
O9 A:SIW302 3.5 23.2 0.1
W2 A:SIW302 3.5 41.9 0.1
W3 A:SIW302 3.5 20.1 0.1
O1E A:SIW302 3.5 25.2 0.1
O18 A:SIW302 3.5 24.1 0.1
W5E A:SIW302 3.5 44.2 0.1
W3E A:SIW302 3.5 39.2 0.1
W2E A:SIW302 3.6 19.8 0.1
W5 A:SIW302 3.6 26.0 0.1
O18 A:SIW302 3.6 23.7 0.1
O9 A:SIW302 3.6 26.4 0.1
W2E A:SIW302 3.6 27.7 0.1
W3 A:SIW302 3.6 17.8 0.1
W2 A:SIW302 3.6 28.0 0.0
O9E A:SIW302 3.6 26.9 0.1
O23E A:SIW302 3.6 31.3 0.1
O15E A:SIW302 3.6 23.4 0.1
O23 A:SIW302 3.6 26.6 0.1
W1E A:SIW302 3.6 10.9 0.1
W5 A:SIW302 3.6 18.5 0.1
O16 A:SIW302 3.6 25.4 0.1
W4 A:SIW302 3.6 11.1 0.1
O16E A:SIW302 3.6 26.0 0.1
O17 A:SIW302 3.6 25.0 0.1
O20 A:SIW302 3.6 28.4 0.1
W1 A:SIW302 3.7 36.7 0.0
O2 A:SIW302 3.7 24.8 0.1
O2E A:SIW302 3.7 26.3 0.1
O17E A:SIW302 3.7 23.8 0.1
O20E A:SIW302 3.7 24.5 0.1
O8 A:SIW302 3.7 27.1 0.1
O11 A:SIW302 3.7 25.2 0.0
O8E A:SIW302 3.7 24.3 0.1
O20E A:SIW302 3.7 26.5 0.1
O23E A:SIW302 3.7 24.6 0.1
O1 A:SIW302 3.7 24.6 0.1
O23 A:SIW302 3.7 23.0 0.1
O1E A:SIW302 3.7 24.7 0.1
W2 A:SIW302 3.7 10.8 0.1
O20 A:SIW302 3.7 26.9 0.0
O8E A:SIW302 3.8 25.8 0.1
O13 A:SIW302 3.8 33.6 0.1
O16E A:SIW302 3.8 25.5 0.1
O18E A:SIW302 3.8 23.6 0.1
W7 A:SIW302 3.8 23.9 0.1
W2 A:SIW302 3.8 10.3 0.1
W1E A:SIW302 3.8 11.4 0.1
O8 A:SIW302 3.8 21.3 0.1
O7 A:SIW302 3.8 27.1 0.1
W4 A:SIW302 3.8 32.8 0.0
O9E A:SIW302 3.9 31.9 0.1
O7E A:SIW302 3.9 25.3 0.1
O18E A:SIW302 3.9 30.1 0.1
O8 A:SIW302 3.9 26.1 0.0
W4 A:SIW302 3.9 10.8 0.1
O2 A:SIW302 3.9 24.3 0.1
O1 A:SIW302 3.9 23.4 0.1
O3 A:SIW302 3.9 29.4 0.1
O11 A:SIW302 3.9 34.2 0.1
O3 A:SIW302 3.9 25.6 0.0
O15 A:SIW302 3.9 23.7 0.1
O15E A:SIW302 3.9 25.1 0.1
O16 A:SIW302 4.0 22.6 0.1
O3E A:SIW302 4.0 29.3 0.1
O15 A:SIW302 4.0 28.9 0.1
O3 A:SIW302 4.0 27.7 0.1
W1 A:SIW302 4.0 11.2 0.1
O3E A:SIW302 4.0 24.2 0.1
O7E A:SIW302 4.0 27.8 0.1
W5E A:SIW302 4.0 33.0 0.0
O13 A:SIW302 4.1 26.1 0.0
O20 A:SIW302 4.1 31.6 0.1
W3E A:SIW302 4.1 12.0 0.1
O5 A:SIW302 4.1 33.9 0.1
O5 A:SIW302 4.1 26.2 0.0
O7 A:SIW302 4.2 22.1 0.1
O9E A:SIW302 4.2 27.2 0.0
O8 A:SIW302 4.2 28.3 0.1
O18E A:SIW302 4.2 26.4 0.0
W1E A:SIW302 4.2 34.7 0.0
W5E A:SIW302 4.2 11.5 0.1
W3E A:SIW302 4.3 36.9 0.0
O3 A:SIW302 4.4 20.6 0.1
O18 A:SIW302 4.5 24.8 0.0
O16 A:SIW302 4.5 31.6 0.1
O7 A:SIW302 4.6 24.8 0.0
O16 A:SIW302 4.7 25.1 0.0
O15E A:SIW302 4.7 30.0 0.1
O15E A:SIW302 4.7 26.1 0.0
O8E A:SIW302 4.7 33.1 0.1
O7 A:SIW302 4.7 31.4 0.1
O18 A:SIW302 4.8 31.9 0.1
O2E A:SIW302 4.8 25.6 0.0
O5 A:SIW302 4.9 30.1 0.1
O13E A:SIW302 4.9 19.4 0.1
W7 A:SIW302 4.9 12.7 0.0
W7 A:SIW302 4.9 28.9 0.1
O1E A:SIW302 4.9 33.4 0.1
O11E A:SIW302 4.9 23.9 0.1
O2E A:SIW302 4.9 31.5 0.1
W4E A:SIW302 5.0 11.9 0.0
O8E A:SIW302 5.0 26.1 0.0

Reference:

H.Noguchi, L.Vandebroek, K.Kamata, J.R.H.Tame, L.Van Meervelt, T.N.Parac-Vogt, A.R.D.Voet. Crystal Structure of the Hybrid Bioinorganic Complex of PIZZA6S and Keggin (Sta) To Be Published.
Page generated: Wed Dec 16 02:09:36 2020

Last articles

Tb in 6TVY
Si in 6Y7O
Rh in 6WRM
Rh in 6WRL
Ni in 6Y8Z
Ni in 6Y8Y
Na in 6ZXZ
Na in 7ACG
Na in 6YLS
Na in 6Y8Z
© Copyright 2008-2020 by atomistry.com
Home   |    Site Map   |    Copyright   |    Contact us   |    Privacy