Silicon in PDB 7zqg: Crystal Structure of PIZZA6-Tnk-Rsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate

The structure of Crystal Structure of PIZZA6-Tnk-Rsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate, PDB code: 7zqg was solved by S.M.L.Wouters, K.Kamata, K.Takahashi, L.Vandebroek, T.N.Parac-Vogt, J.R.H.Tame, A.R.D.Voet, with X-Ray Crystallography technique. A brief refinement statistics is given in the table below:

Resolution Low / High (Å)	49.56 / 1.80
Space group	P 43 21 2
Cell size a, b, c (Å), α, β, γ (°)	70.092, 70.092, 85.055, 90, 90, 90
R / Rfree (%)	18 / 21.1

The structure of Crystal Structure of PIZZA6-Tnk-Rsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate also contains other interesting chemical elements:

Tungsten

(W)

24 atoms

The binding sites of Silicon atom in the Crystal Structure of PIZZA6-Tnk-Rsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate (pdb code 7zqg). This binding sites where shown within 5.0 Angstroms radius around Silicon atom.
In total 2 binding sites of Silicon where determined in the Crystal Structure of PIZZA6-Tnk-Rsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate, PDB code: 7zqg:
Jump to Silicon binding site number: 1; 2;

Silicon binding site 1 out of 2 in the Crystal Structure of PIZZA6-Tnk-Rsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Silicon with other atoms in the Si binding site number 1 of Crystal Structure of PIZZA6-Tnk-Rsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate within 5.0Å range: probe atom residue distance (Å) B Occ A:Si301 b:42.2 occ:0.65 SI1 A:SIW301 0.0 42.2 0.7 O21 A:SIW301 1.0 42.2 0.3 SI1 A:SIW301 1.4 42.2 0.3 O4 A:SIW301 1.5 42.2 0.7 O19E A:SIW301 1.5 42.2 0.7 O21 A:SIW301 1.6 42.2 0.7 O22 A:SIW301 1.7 42.2 0.7 O4 A:SIW301 1.8 42.2 0.3 W7 A:SIW301 1.8 42.2 0.3 O16E A:SIW301 2.2 42.2 0.3 O19E A:SIW301 2.4 42.2 0.3 O7 A:SIW301 2.5 42.2 0.3 O16 A:SIW301 2.6 42.2 0.3 W2 A:SIW301 2.7 42.2 0.3 O22 A:SIW301 2.9 42.2 0.3 O8 A:SIW301 2.9 42.2 0.3 O7E A:SIW301 3.0 42.2 0.3 W4E A:SIW301 3.1 42.2 0.3 O18 A:SIW301 3.1 42.2 0.3 W4 A:SIW301 3.2 42.2 0.3 O16E A:SIW301 3.3 42.2 0.7 W7 A:SIW301 3.3 42.2 0.7 W1 A:SIW301 3.4 42.2 0.3 O3 A:SIW301 3.4 42.2 0.3 W2 A:SIW301 3.4 42.2 0.7 O18E A:SIW301 3.4 42.2 0.7 O7E A:SIW301 3.4 42.2 0.7 W2E A:SIW301 3.5 42.2 0.3 W1 A:SIW301 3.5 42.2 0.7 O9 A:SIW301 3.5 42.2 0.7 W4 A:SIW301 3.5 42.2 0.7 W2E A:SIW301 3.5 42.2 0.7 W3E A:SIW301 3.5 42.2 0.7 W4E A:SIW301 3.5 42.2 0.7 O8 A:SIW301 3.5 42.2 0.7 O6 A:SIW301 3.5 42.2 0.3 O17E A:SIW301 3.6 42.2 0.7 O20E A:SIW301 3.6 42.2 0.7 O1 A:SIW301 3.6 42.2 0.3 O1 A:SIW301 3.6 42.2 0.7 W6 A:SIW301 3.6 42.2 0.7 O23E A:SIW301 3.6 42.2 0.7 W1E A:SIW301 3.6 42.2 0.7 W5 A:SIW301 3.6 42.2 0.7 O2 A:SIW301 3.6 42.2 0.7 O18E A:SIW301 3.6 42.2 0.3 W5E A:SIW301 3.6 42.2 0.7 W3 A:SIW301 3.7 42.2 0.7 O18 A:SIW301 3.7 42.2 0.7 O16 A:SIW301 3.7 42.2 0.7 O3E A:SIW301 3.7 42.2 0.3 O20 A:SIW301 3.8 42.2 0.7 O8E A:SIW301 3.8 42.2 0.3 O3E A:SIW301 3.8 42.2 0.7 O9E A:SIW301 3.8 42.2 0.7 O15E A:SIW301 3.8 42.2 0.7 O7 A:SIW301 3.9 42.2 0.7 O9 A:SIW301 3.9 42.2 0.3 O17 A:SIW301 3.9 42.2 0.7 O8E A:SIW301 3.9 42.2 0.7 O2 A:SIW301 4.0 42.2 0.3 O23 A:SIW301 4.0 42.2 0.7 O2E A:SIW301 4.0 42.2 0.7 O1E A:SIW301 4.0 42.2 0.7 O3 A:SIW301 4.0 42.2 0.7 O20 A:SIW301 4.1 42.2 0.3 W3 A:SIW301 4.1 42.2 0.3 O15 A:SIW301 4.2 42.2 0.7 O2E A:SIW301 4.2 42.2 0.3 W1E A:SIW301 4.3 42.2 0.3 O10 A:SIW301 4.3 42.2 0.3 O1E A:SIW301 4.4 42.2 0.3 W5 A:SIW301 4.5 42.2 0.3 W5E A:SIW301 4.5 42.2 0.3 O15 A:SIW301 4.6 42.2 0.3 O14E A:SIW301 4.6 42.2 0.3 O20E A:SIW301 4.8 42.2 0.3 O9E A:SIW301 4.8 42.2 0.3 O14 A:SIW301 4.8 42.2 0.3 O17 A:SIW301 4.8 42.2 0.3 W3E A:SIW301 4.8 42.2 0.3 O12 A:SIW301 4.9 42.2 0.3 O6 A:SIW301 5.0 42.2 0.7

Silicon binding site 2 out of 2 in the Crystal Structure of PIZZA6-Tnk-Rsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Silicon with other atoms in the Si binding site number 2 of Crystal Structure of PIZZA6-Tnk-Rsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate within 5.0Å range: probe atom residue distance (Å) B Occ A:Si301 b:42.2 occ:0.35 SI1 A:SIW301 0.0 42.2 0.3 O21 A:SIW301 0.9 42.2 0.7 SI1 A:SIW301 1.4 42.2 0.7 O19E A:SIW301 1.4 42.2 0.3 O4 A:SIW301 1.5 42.2 0.3 O21 A:SIW301 1.7 42.2 0.3 O22 A:SIW301 1.7 42.2 0.3 O4 A:SIW301 1.8 42.2 0.7 W2 A:SIW301 2.2 42.2 0.7 O16E A:SIW301 2.3 42.2 0.7 W7 A:SIW301 2.4 42.2 0.7 O8 A:SIW301 2.4 42.2 0.7 O7 A:SIW301 2.4 42.2 0.7 O19E A:SIW301 2.6 42.2 0.7 O22 A:SIW301 2.6 42.2 0.7 O16 A:SIW301 3.0 42.2 0.7 W1 A:SIW301 3.1 42.2 0.7 O1 A:SIW301 3.1 42.2 0.7 W7 A:SIW301 3.2 42.2 0.3 O3 A:SIW301 3.2 42.2 0.7 O18 A:SIW301 3.2 42.2 0.7 W4 A:SIW301 3.2 42.2 0.7 W4E A:SIW301 3.2 42.2 0.7 O16E A:SIW301 3.3 42.2 0.3 O7E A:SIW301 3.3 42.2 0.7 W2E A:SIW301 3.4 42.2 0.3 W4E A:SIW301 3.4 42.2 0.3 W2 A:SIW301 3.5 42.2 0.3 O9 A:SIW301 3.5 42.2 0.7 W3 A:SIW301 3.5 42.2 0.3 W5 A:SIW301 3.5 42.2 0.3 O16 A:SIW301 3.5 42.2 0.3 O18E A:SIW301 3.5 42.2 0.3 W1E A:SIW301 3.5 42.2 0.3 O8E A:SIW301 3.5 42.2 0.3 W4 A:SIW301 3.6 42.2 0.3 W1 A:SIW301 3.6 42.2 0.3 O20 A:SIW301 3.6 42.2 0.3 O9 A:SIW301 3.6 42.2 0.3 O2 A:SIW301 3.6 42.2 0.3 O7E A:SIW301 3.6 42.2 0.3 O1 A:SIW301 3.6 42.2 0.3 W6 A:SIW301 3.6 42.2 0.3 O9E A:SIW301 3.6 42.2 0.3 W3E A:SIW301 3.7 42.2 0.3 O17 A:SIW301 3.7 42.2 0.3 O18 A:SIW301 3.7 42.2 0.3 W5E A:SIW301 3.7 42.2 0.3 O8 A:SIW301 3.7 42.2 0.3 O18E A:SIW301 3.7 42.2 0.7 O1E A:SIW301 3.7 42.2 0.3 O20E A:SIW301 3.7 42.2 0.3 O23 A:SIW301 3.8 42.2 0.3 O2 A:SIW301 3.8 42.2 0.7 O7 A:SIW301 3.8 42.2 0.3 O17E A:SIW301 3.9 42.2 0.3 O15 A:SIW301 3.9 42.2 0.3 W3 A:SIW301 3.9 42.2 0.7 O23E A:SIW301 3.9 42.2 0.3 O2E A:SIW301 3.9 42.2 0.3 O10 A:SIW301 3.9 42.2 0.7 O3E A:SIW301 3.9 42.2 0.3 O3 A:SIW301 4.0 42.2 0.3 O3E A:SIW301 4.0 42.2 0.7 O6 A:SIW301 4.0 42.2 0.7 W2E A:SIW301 4.0 42.2 0.7 O15E A:SIW301 4.0 42.2 0.3 O20 A:SIW301 4.0 42.2 0.7 O2E A:SIW301 4.3 42.2 0.7 W5 A:SIW301 4.4 42.2 0.7 W5E A:SIW301 4.4 42.2 0.7 W1E A:SIW301 4.5 42.2 0.7 O15 A:SIW301 4.6 42.2 0.7 O23E A:SIW301 4.6 42.2 0.7 O8E A:SIW301 4.6 42.2 0.7 O20E A:SIW301 4.6 42.2 0.7 O12 A:SIW301 4.7 42.2 0.7 O17 A:SIW301 4.7 42.2 0.7 W6 A:SIW301 4.8 42.2 0.7 O14E A:SIW301 4.8 42.2 0.7 O14 A:SIW301 4.8 42.2 0.7 O6 A:SIW301 4.8 42.2 0.3 W3E A:SIW301 4.8 42.2 0.7 O15E A:SIW301 4.9 42.2 0.7 O17E A:SIW301 5.0 42.2 0.7 O1E A:SIW301 5.0 42.2 0.7

S.Wouters, K.Kamata, K.Takahashi, L.Vandebroek, T.N.Parac-Vogt, J.R.H.Tame, A.R.D.Voet. Mutational Study of A Symmetry Matched Protein-Polyoxometalate Interface To Be Published.