Silicon in PDB 7zq2: Crystal Structure of PIZZA6-Tnk-Rsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate
Protein crystallography data
The structure of Crystal Structure of PIZZA6-Tnk-Rsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate, PDB code: 7zq2
was solved by
S.M.L.Wouters,
K.Kamata,
K.Takahashi,
L.Vandebroek,
T.N.Parac-Vogt,
J.R.H.Tame,
A.R.D.Voet,
with X-Ray Crystallography technique. A brief refinement statistics is given in the table below:
Resolution Low / High (Å)
|
40.27 /
1.60
|
Space group
|
P 21 21 21
|
Cell size a, b, c (Å), α, β, γ (°)
|
49.245,
61.893,
69.953,
90,
90,
90
|
R / Rfree (%)
|
20 /
22.7
|
Other elements in 7zq2:
The structure of Crystal Structure of PIZZA6-Tnk-Rsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate also contains other interesting chemical elements:
Silicon Binding Sites:
The binding sites of Silicon atom in the Crystal Structure of PIZZA6-Tnk-Rsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate
(pdb code 7zq2). This binding sites where shown within
5.0 Angstroms radius around Silicon atom.
In total 6 binding sites of Silicon where determined in the
Crystal Structure of PIZZA6-Tnk-Rsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate, PDB code: 7zq2:
Jump to Silicon binding site number:
1;
2;
3;
4;
5;
6;
Silicon binding site 1 out
of 6 in 7zq2
Go back to
Silicon Binding Sites List in 7zq2
Silicon binding site 1 out
of 6 in the Crystal Structure of PIZZA6-Tnk-Rsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate
Mono view
Stereo pair view
|
A full contact list of Silicon with other atoms in the Si binding
site number 1 of Crystal Structure of PIZZA6-Tnk-Rsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate within 5.0Å range:
probe
|
atom
|
residue
|
distance (Å)
|
B
|
Occ
|
A:Si301
b:18.4
occ:0.33
|
SI1
|
A:SIW301
|
0.0
|
18.4
|
0.3
|
SI1
|
A:SIW301
|
0.1
|
18.4
|
0.1
|
SI1
|
A:SIW301
|
0.3
|
18.4
|
0.6
|
O19E
|
A:SIW301
|
1.4
|
18.4
|
0.1
|
O4
|
A:SIW301
|
1.4
|
18.4
|
0.6
|
O4
|
A:SIW301
|
1.5
|
18.4
|
0.1
|
O4
|
A:SIW301
|
1.5
|
18.4
|
0.3
|
O19E
|
A:SIW301
|
1.5
|
18.4
|
0.3
|
O21
|
A:SIW301
|
1.5
|
18.4
|
0.6
|
O21
|
A:SIW301
|
1.7
|
18.4
|
0.3
|
O22
|
A:SIW301
|
1.7
|
18.4
|
0.3
|
O19E
|
A:SIW301
|
1.7
|
18.4
|
0.6
|
O21
|
A:SIW301
|
1.7
|
18.4
|
0.1
|
O22
|
A:SIW301
|
1.7
|
18.4
|
0.6
|
O22
|
A:SIW301
|
1.7
|
18.4
|
0.1
|
W2
|
A:SIW301
|
3.2
|
18.4
|
0.6
|
O18
|
A:SIW301
|
3.2
|
18.4
|
0.6
|
W1
|
A:SIW301
|
3.3
|
18.4
|
0.6
|
O7
|
A:SIW301
|
3.3
|
18.4
|
0.6
|
W3E
|
A:SIW301
|
3.4
|
18.4
|
0.1
|
W7
|
A:SIW301
|
3.4
|
18.4
|
0.6
|
O9E
|
A:SIW301
|
3.4
|
18.4
|
0.1
|
O1E
|
A:SIW301
|
3.4
|
18.4
|
0.1
|
W3
|
A:SIW301
|
3.4
|
18.4
|
0.6
|
W4E
|
A:SIW301
|
3.4
|
18.4
|
0.1
|
O16
|
A:SIW301
|
3.4
|
18.4
|
0.6
|
W4E
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.6
|
O20
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.6
|
O18
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.3
|
W7
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.1
|
O8
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.6
|
W1E
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.1
|
W2
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.3
|
W5
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.3
|
W1
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.3
|
W4
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.1
|
W3
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.3
|
W7
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.3
|
W2E
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.3
|
W4
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.3
|
W4
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.6
|
O18
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.1
|
O20E
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.1
|
W2E
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.1
|
O9E
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.3
|
O3
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.6
|
O2
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.3
|
W1
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.1
|
W3E
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.3
|
O20E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.3
|
W4E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.3
|
O16
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.1
|
O16E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.1
|
W2
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.1
|
W5E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.1
|
O18E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.1
|
O1E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.3
|
O20
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.3
|
W5
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.1
|
O18E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.3
|
O9
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.6
|
W5
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.6
|
W6
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.1
|
O2E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.6
|
W3
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.1
|
O9
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.3
|
W1E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.3
|
W5E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.6
|
O16E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.6
|
O15
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.6
|
O18E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.6
|
W6
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.3
|
O17E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.1
|
O16
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.3
|
O17
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.3
|
O17
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.6
|
O15E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.1
|
O1
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.6
|
W2E
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.6
|
O2E
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.3
|
O17
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.1
|
O23E
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.1
|
O8E
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.1
|
O1E
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.6
|
O8E
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.3
|
O3
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.3
|
W5E
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.3
|
W6
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.6
|
O2E
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.1
|
O9
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.1
|
O9E
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.6
|
O7
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.3
|
O16E
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.3
|
O23
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.3
|
O2
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.1
|
O17E
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.3
|
O8
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.3
|
O8E
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.6
|
O23
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.1
|
O2
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.6
|
O1
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.3
|
O7E
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.1
|
O3E
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.1
|
W1E
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.6
|
O8
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.1
|
O23
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.6
|
O20
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.1
|
O7E
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.3
|
W3E
|
A:SIW301
|
3.9
|
18.4
|
0.6
|
O15
|
A:SIW301
|
3.9
|
18.4
|
0.3
|
O1
|
A:SIW301
|
3.9
|
18.4
|
0.1
|
O23E
|
A:SIW301
|
3.9
|
18.4
|
0.3
|
O17E
|
A:SIW301
|
3.9
|
18.4
|
0.6
|
O3
|
A:SIW301
|
3.9
|
18.4
|
0.1
|
O20E
|
A:SIW301
|
4.0
|
18.4
|
0.6
|
O7
|
A:SIW301
|
4.0
|
18.4
|
0.1
|
O3E
|
A:SIW301
|
4.0
|
18.4
|
0.3
|
O23E
|
A:SIW301
|
4.0
|
18.4
|
0.6
|
O15E
|
A:SIW301
|
4.1
|
18.4
|
0.3
|
O15
|
A:SIW301
|
4.1
|
18.4
|
0.1
|
O3E
|
A:SIW301
|
4.1
|
18.4
|
0.6
|
O7E
|
A:SIW301
|
4.1
|
18.4
|
0.6
|
O15E
|
A:SIW301
|
4.2
|
18.4
|
0.6
|
O10
|
A:SIW301
|
4.9
|
18.4
|
0.6
|
O11E
|
A:SIW301
|
5.0
|
18.4
|
0.1
|
O12
|
A:SIW301
|
5.0
|
18.4
|
0.6
|
|
Silicon binding site 2 out
of 6 in 7zq2
Go back to
Silicon Binding Sites List in 7zq2
Silicon binding site 2 out
of 6 in the Crystal Structure of PIZZA6-Tnk-Rsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate
Mono view
Stereo pair view
|
A full contact list of Silicon with other atoms in the Si binding
site number 2 of Crystal Structure of PIZZA6-Tnk-Rsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate within 5.0Å range:
probe
|
atom
|
residue
|
distance (Å)
|
B
|
Occ
|
A:Si301
b:18.4
occ:0.55
|
SI1
|
A:SIW301
|
0.0
|
18.4
|
0.6
|
SI1
|
A:SIW301
|
0.3
|
18.4
|
0.3
|
SI1
|
A:SIW301
|
0.3
|
18.4
|
0.1
|
O19E
|
A:SIW301
|
1.3
|
18.4
|
0.1
|
O4
|
A:SIW301
|
1.4
|
18.4
|
0.3
|
O19E
|
A:SIW301
|
1.4
|
18.4
|
0.3
|
O19E
|
A:SIW301
|
1.5
|
18.4
|
0.6
|
O4
|
A:SIW301
|
1.5
|
18.4
|
0.6
|
O22
|
A:SIW301
|
1.6
|
18.4
|
0.1
|
O4
|
A:SIW301
|
1.6
|
18.4
|
0.1
|
O22
|
A:SIW301
|
1.7
|
18.4
|
0.6
|
O21
|
A:SIW301
|
1.7
|
18.4
|
0.6
|
O22
|
A:SIW301
|
1.7
|
18.4
|
0.3
|
O21
|
A:SIW301
|
1.9
|
18.4
|
0.1
|
O21
|
A:SIW301
|
1.9
|
18.4
|
0.3
|
W3E
|
A:SIW301
|
3.2
|
18.4
|
0.1
|
O9E
|
A:SIW301
|
3.2
|
18.4
|
0.1
|
W3E
|
A:SIW301
|
3.3
|
18.4
|
0.3
|
O20E
|
A:SIW301
|
3.3
|
18.4
|
0.1
|
W1E
|
A:SIW301
|
3.3
|
18.4
|
0.1
|
O1E
|
A:SIW301
|
3.4
|
18.4
|
0.1
|
O1E
|
A:SIW301
|
3.4
|
18.4
|
0.3
|
W6
|
A:SIW301
|
3.4
|
18.4
|
0.1
|
O9E
|
A:SIW301
|
3.4
|
18.4
|
0.3
|
O17E
|
A:SIW301
|
3.4
|
18.4
|
0.1
|
W5
|
A:SIW301
|
3.4
|
18.4
|
0.1
|
O18
|
A:SIW301
|
3.4
|
18.4
|
0.6
|
W2E
|
A:SIW301
|
3.4
|
18.4
|
0.3
|
O9E
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.6
|
O2E
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.3
|
W5E
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.3
|
O20
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.3
|
O1E
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.6
|
W1
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.6
|
W2
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.6
|
W6
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.3
|
O20
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.6
|
W4E
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.3
|
W5
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.6
|
W3
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.6
|
O18
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.3
|
W5E
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.6
|
O18E
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.1
|
W7
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.6
|
W4
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.1
|
O17
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.1
|
W6
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.6
|
O23
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.1
|
O16
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.6
|
W4E
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.6
|
W1
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.3
|
O17E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.3
|
O20E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.3
|
O23E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.1
|
W2E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.6
|
O2E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.6
|
W5E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.1
|
O15E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.1
|
O18E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.6
|
O17
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.6
|
W4
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.6
|
W5
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.3
|
W3
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.1
|
W2E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.1
|
O7
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.6
|
O17
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.3
|
W3E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.6
|
W1E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.3
|
W3
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.3
|
W1E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.6
|
O8E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.6
|
O15
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.6
|
W4E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.1
|
O8E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.1
|
O23
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.6
|
O17E
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.6
|
O8E
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.3
|
O9
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.3
|
O2
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.1
|
W7
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.3
|
O16
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.1
|
O23
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.3
|
W1
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.1
|
O18E
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.3
|
O23E
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.3
|
O9
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.6
|
O3
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.6
|
W7
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.1
|
O2
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.3
|
W4
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.3
|
W2
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.1
|
W2
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.3
|
O8
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.6
|
O18
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.1
|
O9
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.1
|
O20E
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.6
|
O2
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.6
|
O15E
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.3
|
O16E
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.6
|
O16E
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.3
|
O2E
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.1
|
O16E
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.1
|
O16
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.3
|
O1
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.6
|
O23E
|
A:SIW301
|
3.9
|
18.4
|
0.6
|
O3E
|
A:SIW301
|
3.9
|
18.4
|
0.3
|
O7E
|
A:SIW301
|
3.9
|
18.4
|
0.3
|
O20
|
A:SIW301
|
3.9
|
18.4
|
0.1
|
O8
|
A:SIW301
|
3.9
|
18.4
|
0.3
|
O3E
|
A:SIW301
|
3.9
|
18.4
|
0.1
|
O7E
|
A:SIW301
|
3.9
|
18.4
|
0.1
|
O1
|
A:SIW301
|
4.0
|
18.4
|
0.1
|
O7
|
A:SIW301
|
4.0
|
18.4
|
0.3
|
O3
|
A:SIW301
|
4.0
|
18.4
|
0.3
|
O15
|
A:SIW301
|
4.0
|
18.4
|
0.1
|
O15E
|
A:SIW301
|
4.0
|
18.4
|
0.6
|
O1
|
A:SIW301
|
4.0
|
18.4
|
0.3
|
O15
|
A:SIW301
|
4.0
|
18.4
|
0.3
|
O3
|
A:SIW301
|
4.0
|
18.4
|
0.1
|
O8
|
A:SIW301
|
4.0
|
18.4
|
0.1
|
O3E
|
A:SIW301
|
4.1
|
18.4
|
0.6
|
O7E
|
A:SIW301
|
4.1
|
18.4
|
0.6
|
O7
|
A:SIW301
|
4.2
|
18.4
|
0.1
|
O11E
|
A:SIW301
|
4.8
|
18.4
|
0.1
|
O12E
|
A:SIW301
|
4.9
|
18.4
|
0.1
|
O11E
|
A:SIW301
|
4.9
|
18.4
|
0.3
|
O5
|
A:SIW301
|
5.0
|
18.4
|
0.1
|
|
Silicon binding site 3 out
of 6 in 7zq2
Go back to
Silicon Binding Sites List in 7zq2
Silicon binding site 3 out
of 6 in the Crystal Structure of PIZZA6-Tnk-Rsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate
Mono view
Stereo pair view
|
A full contact list of Silicon with other atoms in the Si binding
site number 3 of Crystal Structure of PIZZA6-Tnk-Rsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate within 5.0Å range:
probe
|
atom
|
residue
|
distance (Å)
|
B
|
Occ
|
A:Si301
b:18.4
occ:0.12
|
SI1
|
A:SIW301
|
0.0
|
18.4
|
0.1
|
SI1
|
A:SIW301
|
0.1
|
18.4
|
0.3
|
SI1
|
A:SIW301
|
0.3
|
18.4
|
0.6
|
O4
|
A:SIW301
|
1.4
|
18.4
|
0.1
|
O19E
|
A:SIW301
|
1.5
|
18.4
|
0.1
|
O4
|
A:SIW301
|
1.5
|
18.4
|
0.3
|
O4
|
A:SIW301
|
1.5
|
18.4
|
0.6
|
O21
|
A:SIW301
|
1.5
|
18.4
|
0.6
|
O19E
|
A:SIW301
|
1.6
|
18.4
|
0.3
|
O22
|
A:SIW301
|
1.6
|
18.4
|
0.3
|
O22
|
A:SIW301
|
1.6
|
18.4
|
0.6
|
O21
|
A:SIW301
|
1.7
|
18.4
|
0.1
|
O22
|
A:SIW301
|
1.7
|
18.4
|
0.1
|
O21
|
A:SIW301
|
1.7
|
18.4
|
0.3
|
O19E
|
A:SIW301
|
1.7
|
18.4
|
0.6
|
W2
|
A:SIW301
|
3.2
|
18.4
|
0.6
|
O18
|
A:SIW301
|
3.3
|
18.4
|
0.6
|
W1
|
A:SIW301
|
3.3
|
18.4
|
0.6
|
W3
|
A:SIW301
|
3.3
|
18.4
|
0.6
|
O7
|
A:SIW301
|
3.4
|
18.4
|
0.6
|
W3
|
A:SIW301
|
3.4
|
18.4
|
0.3
|
W7
|
A:SIW301
|
3.4
|
18.4
|
0.6
|
W3E
|
A:SIW301
|
3.4
|
18.4
|
0.1
|
W1
|
A:SIW301
|
3.4
|
18.4
|
0.3
|
W5
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.3
|
W2
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.3
|
O16
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.6
|
O3
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.6
|
W2
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.1
|
W1
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.1
|
W4E
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.1
|
O18
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.3
|
W4
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.1
|
W4
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.6
|
O20
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.6
|
O8
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.6
|
O9E
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.1
|
W7
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.1
|
W5
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.6
|
O2
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.3
|
O18
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.1
|
W3
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.1
|
O15
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.6
|
O9
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.3
|
O1E
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.1
|
O20
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.3
|
O17
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.3
|
O20E
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.1
|
W5
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.1
|
O9
|
A:SIW301
|
3.5
|
18.4
|
0.6
|
O20E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.3
|
O16
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.1
|
W1E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.1
|
W4
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.3
|
W6
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.3
|
O1
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.6
|
O16E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.1
|
O17
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.6
|
W4E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.6
|
W6
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.1
|
O9E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.3
|
W5E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.1
|
W3E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.3
|
W7
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.3
|
O18E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.1
|
O17
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.1
|
W4E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.3
|
O9
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.1
|
O18E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.6
|
W2E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.3
|
W2E
|
A:SIW301
|
3.6
|
18.4
|
0.1
|
O23E
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.1
|
O18E
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.3
|
W6
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.6
|
O1E
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.3
|
O17E
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.1
|
W5E
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.6
|
W5E
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.3
|
O3
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.3
|
W1E
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.3
|
O2E
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.3
|
O23
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.3
|
O2
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.1
|
O2E
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.6
|
O2
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.6
|
O16E
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.6
|
O15E
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.1
|
O16
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.3
|
O1
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.3
|
O8
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.3
|
O9E
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.6
|
O8
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.1
|
O17E
|
A:SIW301
|
3.7
|
18.4
|
0.3
|
O23
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.6
|
O7
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.3
|
W2E
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.6
|
O2E
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.1
|
O23
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.1
|
O8E
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.1
|
O1E
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.6
|
O1
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.1
|
O8E
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.3
|
O15
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.3
|
O16E
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.3
|
O20
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.1
|
W1E
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.6
|
O8E
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.6
|
O23E
|
A:SIW301
|
3.8
|
18.4
|
0.3
|
O3
|
A:SIW301
|
3.9
|
18.4
|
0.1
|
O7E
|
A:SIW301
|
3.9
|
18.4
|
0.1
|
O3E
|
A:SIW301
|
3.9
|
18.4
|
0.1
|
O17E
|
A:SIW301
|
3.9
|
18.4
|
0.6
|
W3E
|
A:SIW301
|
3.9
|
18.4
|
0.6
|
O20E
|
A:SIW301
|
3.9
|
18.4
|
0.6
|
O7
|
A:SIW301
|
3.9
|
18.4
|
0.1
|
O7E
|
A:SIW301
|
4.0
|
18.4
|
0.3
|
O15
|
A:SIW301
|
4.0
|
18.4
|
0.1
|
O23E
|
A:SIW301
|
4.0
|
18.4
|
0.6
|
O15E
|
A:SIW301
|
4.1
|
18.4
|
0.3
|
O3E
|
A:SIW301
|
4.1
|
18.4
|
0.3
|
O7E
|
A:SIW301
|
4.2
|
18.4
|
0.6
|
O3E
|
A:SIW301
|
4.2
|
18.4
|
0.6
|
O15E
|
A:SIW301
|
4.2
|
18.4
|
0.6
|
O10
|
A:SIW301
|
4.9
|
18.4
|
0.6
|
O12
|
A:SIW301
|
5.0
|
18.4
|
0.6
|
|
Silicon binding site 4 out
of 6 in 7zq2
Go back to
Silicon Binding Sites List in 7zq2
Silicon binding site 4 out
of 6 in the Crystal Structure of PIZZA6-Tnk-Rsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate
Mono view
Stereo pair view
|
A full contact list of Silicon with other atoms in the Si binding
site number 4 of Crystal Structure of PIZZA6-Tnk-Rsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate within 5.0Å range:
probe
|
atom
|
residue
|
distance (Å)
|
B
|
Occ
|
A:Si302
b:60.8
occ:0.23
|
SI1
|
A:SIW302
|
0.0
|
60.8
|
0.2
|
O19E
|
A:SIW302
|
1.5
|
60.8
|
0.2
|
O4
|
A:SIW302
|
1.5
|
60.8
|
0.2
|
O22
|
A:SIW302
|
1.7
|
60.8
|
0.2
|
O21
|
A:SIW302
|
1.7
|
60.8
|
0.2
|
W7
|
A:SIW302
|
3.5
|
60.8
|
0.2
|
W2
|
A:SIW302
|
3.5
|
60.8
|
0.2
|
W1
|
A:SIW302
|
3.5
|
60.8
|
0.2
|
W5
|
A:SIW302
|
3.5
|
60.8
|
0.2
|
W1E
|
A:SIW302
|
3.5
|
60.8
|
0.2
|
W4
|
A:SIW302
|
3.5
|
60.8
|
0.2
|
W6
|
A:SIW302
|
3.5
|
60.8
|
0.2
|
O18E
|
A:SIW302
|
3.5
|
60.8
|
0.2
|
W3
|
A:SIW302
|
3.5
|
60.8
|
0.2
|
O9
|
A:SIW302
|
3.6
|
60.8
|
0.2
|
W3E
|
A:SIW302
|
3.6
|
60.8
|
0.2
|
O9E
|
A:SIW302
|
3.6
|
60.8
|
0.2
|
W2E
|
A:SIW302
|
3.6
|
60.8
|
0.2
|
O18
|
A:SIW302
|
3.6
|
60.8
|
0.2
|
O16
|
A:SIW302
|
3.6
|
60.8
|
0.2
|
W5E
|
A:SIW302
|
3.6
|
60.8
|
0.2
|
W4E
|
A:SIW302
|
3.6
|
60.8
|
0.2
|
O16E
|
A:SIW302
|
3.6
|
60.8
|
0.2
|
O8
|
A:SIW302
|
3.6
|
60.8
|
0.2
|
O20E
|
A:SIW302
|
3.7
|
60.8
|
0.2
|
O8E
|
A:SIW302
|
3.7
|
60.8
|
0.2
|
O20
|
A:SIW302
|
3.7
|
60.8
|
0.2
|
O2
|
A:SIW302
|
3.7
|
60.8
|
0.2
|
O17E
|
A:SIW302
|
3.7
|
60.8
|
0.2
|
O17
|
A:SIW302
|
3.7
|
60.8
|
0.2
|
O23E
|
A:SIW302
|
3.7
|
60.8
|
0.2
|
O23
|
A:SIW302
|
3.7
|
60.8
|
0.2
|
O1
|
A:SIW302
|
3.7
|
60.8
|
0.2
|
O2E
|
A:SIW302
|
3.8
|
60.8
|
0.2
|
O1E
|
A:SIW302
|
3.8
|
60.8
|
0.2
|
O7
|
A:SIW302
|
3.8
|
60.8
|
0.2
|
O7E
|
A:SIW302
|
3.8
|
60.8
|
0.2
|
O15
|
A:SIW302
|
3.9
|
60.8
|
0.2
|
O15E
|
A:SIW302
|
4.0
|
60.8
|
0.2
|
O3
|
A:SIW302
|
4.0
|
60.8
|
0.2
|
O3E
|
A:SIW302
|
4.1
|
60.8
|
0.2
|
|
Silicon binding site 5 out
of 6 in 7zq2
Go back to
Silicon Binding Sites List in 7zq2
Silicon binding site 5 out
of 6 in the Crystal Structure of PIZZA6-Tnk-Rsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate
Mono view
Stereo pair view
|
A full contact list of Silicon with other atoms in the Si binding
site number 5 of Crystal Structure of PIZZA6-Tnk-Rsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate within 5.0Å range:
probe
|
atom
|
residue
|
distance (Å)
|
B
|
Occ
|
A:Si303
b:50.9
occ:0.18
|
SI1
|
A:SIW303
|
0.0
|
50.9
|
0.2
|
O19E
|
A:SIW303
|
1.5
|
50.9
|
0.2
|
O4
|
A:SIW303
|
1.5
|
50.9
|
0.2
|
O22
|
A:SIW303
|
1.7
|
50.9
|
0.2
|
O21
|
A:SIW303
|
1.7
|
50.9
|
0.2
|
O9
|
A:SIW303
|
3.5
|
50.9
|
0.2
|
W4
|
A:SIW303
|
3.5
|
50.9
|
0.2
|
O18E
|
A:SIW303
|
3.5
|
50.9
|
0.2
|
W7
|
A:SIW303
|
3.5
|
50.9
|
0.2
|
W1
|
A:SIW303
|
3.5
|
50.9
|
0.2
|
W2
|
A:SIW303
|
3.5
|
50.9
|
0.2
|
W6
|
A:SIW303
|
3.5
|
50.9
|
0.2
|
W1E
|
A:SIW303
|
3.5
|
50.9
|
0.2
|
W3E
|
A:SIW303
|
3.5
|
50.9
|
0.2
|
W3
|
A:SIW303
|
3.5
|
50.9
|
0.2
|
W5
|
A:SIW303
|
3.5
|
50.9
|
0.2
|
W5E
|
A:SIW303
|
3.6
|
50.9
|
0.2
|
W2E
|
A:SIW303
|
3.6
|
50.9
|
0.2
|
W4E
|
A:SIW303
|
3.6
|
50.9
|
0.2
|
O18
|
A:SIW303
|
3.6
|
50.9
|
0.2
|
O9E
|
A:SIW303
|
3.6
|
50.9
|
0.2
|
O16E
|
A:SIW303
|
3.6
|
50.9
|
0.2
|
O2
|
A:SIW303
|
3.6
|
50.9
|
0.2
|
O16
|
A:SIW303
|
3.6
|
50.9
|
0.2
|
O20
|
A:SIW303
|
3.6
|
50.9
|
0.2
|
O20E
|
A:SIW303
|
3.6
|
50.9
|
0.2
|
O17
|
A:SIW303
|
3.6
|
50.9
|
0.2
|
O17E
|
A:SIW303
|
3.7
|
50.9
|
0.2
|
O8
|
A:SIW303
|
3.7
|
50.9
|
0.2
|
O23E
|
A:SIW303
|
3.7
|
50.9
|
0.2
|
O8E
|
A:SIW303
|
3.7
|
50.9
|
0.2
|
O2E
|
A:SIW303
|
3.7
|
50.9
|
0.2
|
O1
|
A:SIW303
|
3.7
|
50.9
|
0.2
|
O1E
|
A:SIW303
|
3.7
|
50.9
|
0.2
|
O23
|
A:SIW303
|
3.7
|
50.9
|
0.2
|
O7E
|
A:SIW303
|
3.8
|
50.9
|
0.2
|
O7
|
A:SIW303
|
3.8
|
50.9
|
0.2
|
O15
|
A:SIW303
|
4.0
|
50.9
|
0.2
|
O15E
|
A:SIW303
|
4.0
|
50.9
|
0.2
|
O3
|
A:SIW303
|
4.0
|
50.9
|
0.2
|
O3E
|
A:SIW303
|
4.0
|
50.9
|
0.2
|
|
Silicon binding site 6 out
of 6 in 7zq2
Go back to
Silicon Binding Sites List in 7zq2
Silicon binding site 6 out
of 6 in the Crystal Structure of PIZZA6-Tnk-Rsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate
Mono view
Stereo pair view
|
A full contact list of Silicon with other atoms in the Si binding
site number 6 of Crystal Structure of PIZZA6-Tnk-Rsh with Silicotungstic Acid (Sta) Polyoxometalate within 5.0Å range:
probe
|
atom
|
residue
|
distance (Å)
|
B
|
Occ
|
A:Si304
b:30.5
occ:0.39
|
SI1
|
A:SIW304
|
0.0
|
30.5
|
0.4
|
O19E
|
A:SIW304
|
1.5
|
30.5
|
0.4
|
O4
|
A:SIW304
|
1.5
|
30.5
|
0.4
|
O22
|
A:SIW304
|
1.7
|
30.5
|
0.4
|
O21
|
A:SIW304
|
1.7
|
30.5
|
0.4
|
W7
|
A:SIW304
|
3.2
|
30.5
|
0.4
|
O16E
|
A:SIW304
|
3.4
|
30.5
|
0.4
|
O18E
|
A:SIW304
|
3.5
|
30.5
|
0.4
|
W2
|
A:SIW304
|
3.5
|
30.5
|
0.4
|
W2E
|
A:SIW304
|
3.5
|
30.5
|
0.4
|
W5E
|
A:SIW304
|
3.5
|
30.5
|
0.4
|
O9
|
A:SIW304
|
3.5
|
30.5
|
0.4
|
W1E
|
A:SIW304
|
3.5
|
30.5
|
0.4
|
W6
|
A:SIW304
|
3.5
|
30.5
|
0.4
|
W3E
|
A:SIW304
|
3.5
|
30.5
|
0.4
|
W3
|
A:SIW304
|
3.5
|
30.5
|
0.4
|
O17E
|
A:SIW304
|
3.5
|
30.5
|
0.4
|
O8
|
A:SIW304
|
3.6
|
30.5
|
0.4
|
O23E
|
A:SIW304
|
3.6
|
30.5
|
0.4
|
W4E
|
A:SIW304
|
3.6
|
30.5
|
0.4
|
W1
|
A:SIW304
|
3.6
|
30.5
|
0.4
|
W5
|
A:SIW304
|
3.6
|
30.5
|
0.4
|
W4
|
A:SIW304
|
3.6
|
30.5
|
0.4
|
O20E
|
A:SIW304
|
3.6
|
30.5
|
0.4
|
O7E
|
A:SIW304
|
3.6
|
30.5
|
0.4
|
O2
|
A:SIW304
|
3.6
|
30.5
|
0.4
|
O9E
|
A:SIW304
|
3.7
|
30.5
|
0.4
|
O18
|
A:SIW304
|
3.7
|
30.5
|
0.4
|
O1
|
A:SIW304
|
3.7
|
30.5
|
0.4
|
O20
|
A:SIW304
|
3.7
|
30.5
|
0.4
|
O17
|
A:SIW304
|
3.7
|
30.5
|
0.4
|
O2E
|
A:SIW304
|
3.7
|
30.5
|
0.4
|
O8E
|
A:SIW304
|
3.7
|
30.5
|
0.4
|
O7
|
A:SIW304
|
3.8
|
30.5
|
0.4
|
O16
|
A:SIW304
|
3.8
|
30.5
|
0.4
|
O15E
|
A:SIW304
|
3.8
|
30.5
|
0.4
|
O23
|
A:SIW304
|
3.8
|
30.5
|
0.4
|
O1E
|
A:SIW304
|
3.9
|
30.5
|
0.4
|
O3E
|
A:SIW304
|
3.9
|
30.5
|
0.4
|
O15
|
A:SIW304
|
4.0
|
30.5
|
0.4
|
O3
|
A:SIW304
|
4.1
|
30.5
|
0.4
|
O6
|
A:SIW304
|
4.9
|
30.5
|
0.4
|
|
Reference:
S.Wouters,
K.Kamata,
K.Takahashi,
L.Vandebroek,
T.N.Parac-Vogt,
J.R.H.Tame,
A.R.D.Voet.
Mutational Study of A Symmetry Matched Protein-Polyoxometalate Interface To Be Published.
Page generated: Thu Oct 10 13:41:21 2024
|